More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0534 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0534  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 261 aa  520  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  36.71 
 
 		 330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 318 aa  135  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  33.46 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 327 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 329 aa  118  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 347 aa  115  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 352 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 335 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 330 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  31.6 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  29.92 
 
 		 317 aa  99.4  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 319 aa  95.9  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  30.64 
 
 		 319 aa  95.9  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  30.64 
 
 		 319 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  30.64 
 
 		 319 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 318 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 318 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 318 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 318 aa  95.1  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 316 aa  94.7  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 319 aa  94  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 322 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 777 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  27.69 
 
 		 288 aa  92.4  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.53 
 
 		 304 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01356  DNA-binding transcriptional dual regulator  27.38 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2261  transcriptional regulator, AraC family  27.38 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00485013  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2271  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.38 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  30.14 
 
 		 309 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01369  hypothetical protein  27.38 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1471  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.38 
 
 		 301 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1569  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.38 
 
 		 301 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  26.69 
 
 		 318 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 389 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 330 aa  89.7  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  29.48 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 321 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  35.54 
 
 		 791 aa  86.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 791 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  28.94 
 
 		 340 aa  86.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 318 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 		 330 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  27.82 
 
 		 348 aa  85.9  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  29.48 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 791 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  30.04 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3261  helix-turn-helix domain-containing protein  29.1 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000231694  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  29.82 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.67 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2823  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599889  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.69 
 
 		 314 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2794  helix-turn-helix domain-containing protein  30.71 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.474523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  28.91 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1604  AraC family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3807  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.13417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3660  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.954099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6715  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.74 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 844 aa  74.7  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0488  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0131  transcriptional regulator, AraC family  28.16 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 321 aa  72  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4563  transcriptional regulator, AraC family  27.52 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.409707 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 338 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7852  AraC family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 338 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4995  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  23.26 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0608  helix-turn-helix domain-containing protein  30.19 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.896231  normal  0.142741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5389  transcriptional regulator, AraC family  28.35 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0619  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1512  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 354 aa  68.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4762  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  26.88 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>