More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2794 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2794  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  598  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.474523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7852  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 338 aa  79  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2823  AraC family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599889  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3660  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.954099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0534  transcriptional regulator, AraC family  31.56 
 
 		 261 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 791 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5067  AraC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  30.28 
 
 		 791 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2002  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  32.08 
 
 		 791 aa  69.3  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3261  helix-turn-helix domain-containing protein  30.19 
 
 		 339 aa  68.9  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000231694  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 777 aa  65.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 367 aa  65.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0131  transcriptional regulator, AraC family  28.86 
 
 		 328 aa  65.9  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0893  putative HTH-type regulatory protein, AraC family  30.71 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.364356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  33.61 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6267  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0938445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  27.51 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 354 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3808  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 377 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2695  AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4326  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1419  transcriptional regulator  31.9 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1154  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569492  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5389  transcriptional regulator, AraC family  34.51 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  31.52 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  31.82 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1779  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.255898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1722  two component AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 508 aa  59.3  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4450  transcriptional regulator, AraC family  29.95 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  0.0834018 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 350 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0126  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.338176  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0251  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1058  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4458  transcriptional regulator, AraC family  35.19 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00884299 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  32.93 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001306  putative ARAC-type regulatory protein  33.01 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2999  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  30.11 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 327 aa  57  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  33.02 
 
 		 288 aa  57  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2274  AraC family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 392 aa  57  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01362  hypothetical protein  33.65 
 
 		 1141 aa  56.6  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2962  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 325 aa  56.6  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  33.75 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3134  helix-turn-helix domain-containing protein  35.87 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3108  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05185  hypothetical protein  32.04 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1604  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 354 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  32.5 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4762  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  37.35 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1666  AraC/XylS family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 1121 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4437  transcriptional activator RhaS  40.7 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 352 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3156  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 368 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2046  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 345 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4308  AraC family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 321 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0968012 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  28.17 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 390 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004105  signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 1125 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 338 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1131  transcriptional regulator, AraC family  34.12 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.079056 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  34.04 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2534  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>