More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1666 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01362  hypothetical protein  39.52 
 
 		 1141 aa  814    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004105  signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 		 1125 aa  814    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1666  AraC/XylS family transcriptional regulator  100 
 
 		 1121 aa  2310    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  19.78 
 
 		 1334 aa  104  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  25.37 
 
 		 1114 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  21.34 
 
 		 1316 aa  100  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  22.6 
 
 		 1378 aa  90.1  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  37.86 
 
 		 1343 aa  85.1  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  40.2 
 
 		 993 aa  82.8  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  21.12 
 
 		 1054 aa  80.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  32.11 
 
 		 1340 aa  79.7  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2733  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  21.45 
 
 		 965 aa  79.7  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  19.73 
 
 		 1070 aa  79.3  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02325  GGDEF domain protein  21.66 
 
 		 949 aa  79  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.14 
 
 		 1396 aa  78.6  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  23.93 
 
 		 1370 aa  77.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  22.62 
 
 		 1024 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  23.07 
 
 		 1388 aa  75.5  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  23.28 
 
 		 1034 aa  74.7  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 331 aa  73.6  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  34.55 
 
 		 1374 aa  73.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  30.82 
 
 		 1344 aa  73.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  21.5 
 
 		 1327 aa  73.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06199  Putative signal protein with GGDEF domain  22.66 
 
 		 990 aa  72  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00967  Putative signal protein with GGDEF domain  22.66 
 
 		 990 aa  72  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0579558  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  29.86 
 
 		 1306 aa  71.6  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.18 
 
 		 1258 aa  72  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  22.15 
 
 		 1086 aa  71.2  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  20.24 
 
 		 1070 aa  70.9  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  22.37 
 
 		 1313 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  20.06 
 
 		 1185 aa  70.9  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  23.31 
 
 		 1355 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1711  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 309 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.311162  normal  0.0412412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4009  helix-turn-helix domain-containing protein  35.58 
 
 		 309 aa  69.7  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125602  normal  0.35131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  27.4 
 
 		 663 aa  69.7  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  21.84 
 
 		 1400 aa  69.7  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  32.43 
 
 		 1335 aa  69.7  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  22.7 
 
 		 1053 aa  69.3  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  36.04 
 
 		 904 aa  69.3  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00426  putative two-component system sensor kinase/response regulator fusion protein  38.71 
 
 		 1280 aa  69.3  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 546 aa  68.9  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0415  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.19 
 
 		 1486 aa  68.9  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0967  GGDEF family protein  25.99 
 
 		 976 aa  68.6  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1127  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  31.78 
 
 		 1414 aa  68.6  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  26.13 
 
 		 1366 aa  68.6  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  20.41 
 
 		 1278 aa  68.6  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.28 
 
 		 1237 aa  68.2  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3270  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 544 aa  68.2  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  33.64 
 
 		 1376 aa  67.8  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  28.04 
 
 		 1342 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  22.73 
 
 		 1046 aa  67.4  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 777 aa  67  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 332 aa  67  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 517 aa  67  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 298 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 285 aa  67  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  39.22 
 
 		 324 aa  67  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.953379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 1349 aa  66.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1435  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 324 aa  66.2  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 791 aa  66.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6981  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 345 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0671274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2007  two component AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 529 aa  66.2  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1506  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 345 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570084  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6323  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 345 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1408  helix-turn-helix domain-containing protein  38.24 
 
 		 324 aa  66.2  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2946  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  20.6 
 
 		 1276 aa  65.9  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  21.43 
 
 		 1278 aa  65.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  27.43 
 
 		 1374 aa  65.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  28.95 
 
 		 1404 aa  65.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  38.38 
 
 		 538 aa  65.5  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 791 aa  65.5  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4591  two component transcriptional regulator, AraC family  41.86 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2723  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  30.36 
 
 		 1296 aa  65.1  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  32.38 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  20.65 
 
 		 1118 aa  64.3  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 386 aa  64.3  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  28 
 
 		 1366 aa  64.3  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3660  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 332 aa  64.3  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.954099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  30.17 
 
 		 1374 aa  64.3  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3887  two component AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 252 aa  64.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3330  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 257 aa  64.3  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.865476  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 513 aa  63.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 519 aa  63.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5587  transcriptional regulator, AraC family  32.85 
 
 		 291 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.425806  normal  0.825086 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 287 aa  63.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  22.61 
 
 		 967 aa  63.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3156  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 368 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  29.17 
 
 		 1324 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  37.89 
 
 		 365 aa  63.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0876  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 405 aa  63.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2373  two component transcriptional regulator, AraC family  31.67 
 
 		 252 aa  63.2  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  33.05 
 
 		 1344 aa  63.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  31.37 
 
 		 1384 aa  63.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2237  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 310 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 934 aa  63.2  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  34.65 
 
 		 347 aa  63.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0442  hypothetical protein  38.46 
 
 		 326 aa  62.8  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  29 
 
 		 1298 aa  63.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>