More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00426 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00426  putative two-component system sensor kinase/response regulator fusion protein  100 
 
 		 1280 aa  2623    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  26.46 
 
 		 1355 aa  231  7e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  26.3 
 
 		 1344 aa  216  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  25.41 
 
 		 1343 aa  215  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  25.53 
 
 		 1340 aa  214  7e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  23.98 
 
 		 1370 aa  211  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  24.94 
 
 		 1334 aa  206  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  25.65 
 
 		 1311 aa  203  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  28.08 
 
 		 961 aa  199  3e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  25.71 
 
 		 1373 aa  197  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  27.8 
 
 		 663 aa  196  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  25.92 
 
 		 1306 aa  195  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  26.38 
 
 		 1374 aa  195  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  24.36 
 
 		 1363 aa  194  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  27.05 
 
 		 1366 aa  192  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  24.35 
 
 		 1298 aa  191  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  26.21 
 
 		 904 aa  190  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  24.62 
 
 		 993 aa  190  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 1341 aa  191  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  25 
 
 		 1347 aa  190  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  25.28 
 
 		 1378 aa  187  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  23.78 
 
 		 1347 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  27.27 
 
 		 1313 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  26.5 
 
 		 1344 aa  186  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  26.93 
 
 		 934 aa  186  3e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  23.7 
 
 		 1396 aa  183  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  24.8 
 
 		 1384 aa  182  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  24.81 
 
 		 1335 aa  178  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  24.01 
 
 		 1355 aa  177  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  23.12 
 
 		 1366 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  22.08 
 
 		 1397 aa  176  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  22.91 
 
 		 1342 aa  175  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  24.49 
 
 		 1374 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  25.58 
 
 		 1296 aa  175  5e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  21.6 
 
 		 1418 aa  174  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  23.71 
 
 		 1400 aa  173  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 		 1431 aa  172  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  23.77 
 
 		 1324 aa  171  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 978 aa  170  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  29.34 
 
 		 919 aa  169  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  22.36 
 
 		 1378 aa  169  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  24.64 
 
 		 1349 aa  169  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  25.4 
 
 		 1388 aa  168  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  25.76 
 
 		 1414 aa  167  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  24.67 
 
 		 1404 aa  164  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  22.48 
 
 		 1327 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 		 1118 aa  160  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1470  histidine kinase  24.45 
 
 		 1376 aa  160  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0500626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  22.81 
 
 		 1278 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  24.81 
 
 		 940 aa  159  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  21.8 
 
 		 1316 aa  159  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  27.7 
 
 		 668 aa  159  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.64 
 
 		 1559 aa  157  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  25.63 
 
 		 677 aa  155  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  29.61 
 
 		 1180 aa  155  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 		 1390 aa  154  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  25.5 
 
 		 1526 aa  154  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 1048 aa  154  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 		 1390 aa  154  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  28.74 
 
 		 1156 aa  152  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  23.58 
 
 		 1374 aa  152  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 1131 aa  152  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 		 1390 aa  152  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.22 
 
 		 975 aa  151  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  22.86 
 
 		 1373 aa  151  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 1361 aa  146  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 1383 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  28.33 
 
 		 1299 aa  145  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 		 979 aa  143  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 		 1385 aa  142  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  26.26 
 
 		 1152 aa  142  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.78 
 
 		 1426 aa  142  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 1002 aa  141  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 1013 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 		 678 aa  140  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00885051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.64 
 
 		 1287 aa  140  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 1003 aa  139  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  27.25 
 
 		 1427 aa  138  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  30.38 
 
 		 736 aa  139  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 1140 aa  138  7.000000000000001e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.18 
 
 		 1406 aa  138  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 		 1631 aa  137  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3061  ATP-binding region ATPase domain protein  27.41 
 
 		 863 aa  137  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141845  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.96 
 
 		 1646 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.21 
 
 		 1248 aa  137  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.04 
 
 		 1977 aa  135  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 1370 aa  134  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2544  sensor histidine kinase/response regulator  31.34 
 
 		 1019 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 1383 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  26.62 
 
 		 876 aa  134  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 		 568 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000536  autoinducer 2 sensor kinase/phosphatase LuxQ  28.42 
 
 		 858 aa  132  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  30.24 
 
 		 1119 aa  132  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3167  signal transduction histidine kinase-like protein  26.56 
 
 		 1077 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540842 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2670  histidine kinase  30.44 
 
 		 667 aa  131  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.754609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2619  histidine kinase  30.44 
 
 		 667 aa  132  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.01076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.75 
 
 		 1331 aa  131  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  24.36 
 
 		 816 aa  130  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  24.36 
 
 		 816 aa  131  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.35 
 
 		 1301 aa  131  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>