More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3027 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 331 aa  672    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2962  AraC family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3660  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.954099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2823  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599889  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7852  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 338 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 347 aa  99.4  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  27.3 
 
 		 311 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  27.73 
 
 		 288 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 352 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 346 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 346 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  28.1 
 
 		 317 aa  97.1  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 346 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  26.01 
 
 		 324 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 327 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  27.63 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0131  transcriptional regulator, AraC family  29.51 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2002  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 340 aa  89.7  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 367 aa  89.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 339 aa  87.8  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 319 aa  86.7  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  28.16 
 
 		 321 aa  86.3  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 342 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  25.46 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1695  transcriptional regulator, AraC family  26.96 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1928  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0979151  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  22.98 
 
 		 322 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0150  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.09 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  27.41 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 777 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0324  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.645662 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0126  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.338176  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.11 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2046  AraC family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  38.74 
 
 		 791 aa  76.6  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  26.01 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2723  helix-turn-helix domain-containing protein  23.17 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  25.95 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3156  AraC family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 368 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3613  AraC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.350742  normal  0.0515113 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4500  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0180  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.34579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  26.38 
 
 		 791 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  26.89 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  24.76 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  26.89 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  45 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  26.89 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1666  AraC/XylS family transcriptional regulator  39 
 
 		 1121 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4762  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  28.65 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1731  AraC family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2090  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.639887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3807  AraC family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal  0.13417 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3102  AraC family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 325 aa  72.8  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.48 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 791 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  24 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1779  AraC family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.255898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4055  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31.48 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.383418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  32.62 
 
 		 492 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  33.59 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4995  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3137  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.806446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0619  transcriptional regulator, AraC family  26.69 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274384 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  26.3 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3881  transcriptional regulator, AraC family  27.61 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1405  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00191639 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 336 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>