More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2962 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2962  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 338 aa  692    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7852  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2823  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599889  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3660  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.954099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0126  transcriptional regulator, AraC family  38.62 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.338176  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 335 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 346 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0131  transcriptional regulator, AraC family  38.69 
 
 		 328 aa  90.9  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  24.25 
 
 		 311 aa  86.7  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0150  AraC family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291508 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4721  helix-turn-helix domain-containing protein  25.55 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  38.21 
 
 		 319 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3156  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 791 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3137  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.806446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  26.21 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 791 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  33.12 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4500  AraC family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 354 aa  75.9  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4995  AraC family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2002  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 340 aa  75.9  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3102  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0324  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.645662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7049  AraC family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1443  AraC family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.559514  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2259  helix-turn-helix domain-containing protein  42.06 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6385  AraC family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6928  AraC family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1831  transcriptional regulator, AraC family  25.72 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366061  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  22.9 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.91 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1695  transcriptional regulator, AraC family  28.22 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1928  AraC family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0979151  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2412  AraC family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  33.9 
 
 		 791 aa  73.2  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  25.66 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  25.66 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1666  AraC/XylS family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 1121 aa  72  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0180  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.34579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  29.73 
 
 		 316 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  25.66 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1732  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0413947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3516  AraC family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4762  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  26.39 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5389  transcriptional regulator, AraC family  24.22 
 
 		 335 aa  69.7  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0853  AraC family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0449934  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  26.7 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5309  AraC family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0311783  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 777 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  29.2 
 
 		 515 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 327 aa  67  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1731  AraC family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  30.18 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  24.84 
 
 		 309 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6470  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 350 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282147  normal  0.882875 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2007  two component AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 529 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5718  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795949  normal  0.796756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.11 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2794  helix-turn-helix domain-containing protein  36.47 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.474523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4055  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>