More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1731 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1731  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 302 aa  611  9.999999999999999e-175  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0591  AraC family transcriptional regulator  58.86 
 
 		 321 aa  346  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  60.07 
 
 		 313 aa  342  4e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1388  AraC family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 336 aa  316  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00534804  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1189  AraC family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 550 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.459992  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0013  AraC family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 485 aa  315  8e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344073  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1151  AraC family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 342 aa  314  9e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0648007  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4141  AraC family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 307 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0368552 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1337  AraC family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 600 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.477585 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0149  AraC family transcriptional regulator  53.5 
 
 		 331 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511163  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0427  AraC family transcriptional regulator  53.5 
 
 		 331 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1411  AraC family transcriptional regulator  53.5 
 
 		 337 aa  308  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1497  AraC family transcription regulator  53.5 
 
 		 337 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141505  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3855  AraC family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 313 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4513  AraC family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 313 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.24786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5791  AraC family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 313 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3944  AraC family transcriptional regulator  54.51 
 
 		 313 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4407  AraC family transcriptional regulator  54.51 
 
 		 313 aa  305  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.332097 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4009  helix-turn-helix domain-containing protein  51.7 
 
 		 309 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125602  normal  0.35131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1711  AraC family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.311162  normal  0.0412412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2237  AraC family transcriptional regulator  48.79 
 
 		 310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 430 aa  93.2  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  32.39 
 
 		 304 aa  89  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  31.47 
 
 		 303 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  32.17 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  32.17 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  32.17 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  32.17 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 546 aa  83.2  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1003  transcriptional regulator, AraC family  25.74 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03839  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.76 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4032  transcriptional regulator, AraC family  36.76 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4400  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.370971  normal  0.467233 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2158  two component transcriptional regulator, AraC family  39.17 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4062  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4492  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.494011  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  33.94 
 
 		 538 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03788  hypothetical protein  36.76 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5413  transcriptional regulator, AraC family  36.76 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  29.09 
 
 		 519 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4188  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  29.86 
 
 		 365 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2253  two component AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 532 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1280  two component transcriptional regulator, AraC family  33.1 
 
 		 492 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4445  AraC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00788504 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4327  transcriptional regulator, AraC family protein  36.03 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4358  transcriptional regulator, AraC family protein  36.03 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2714  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  0.456872 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4522  AraC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000425632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4448  AraC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172214 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5735  transcriptional regulator AraC family  27.11 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 530 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 517 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  34.34 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 513 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 506 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  25.44 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  22.79 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  31.68 
 
 		 537 aa  73.9  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1732  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0413947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1750  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  39.78 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 533 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  27.83 
 
 		 529 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 356 aa  72.4  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2711  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.37 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  27.83 
 
 		 529 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  25.09 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  22.94 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1698  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 686 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000348751  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1432  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 686 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00438113  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  26.33 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2105  putative sigma54 specific transcriptional regulator  39 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.619214  normal  0.0553697 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0496  two component AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 543 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002640  transcriptional regulator AraC family  28.57 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2506  transcriptional regulator, AraC family  32.46 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.65 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2823  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599889  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  31.31 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  29.59 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3661  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4740  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287591  normal  0.0863508 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0868  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3531  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>