More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1750 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1750  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 359 aa  720    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  30.47 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 548 aa  92  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  43.75 
 
 		 303 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  43.75 
 
 		 303 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  43.75 
 
 		 303 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  43.75 
 
 		 303 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  43.75 
 
 		 303 aa  90.5  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4087  two component transcriptional regulator, AraC family  25.71 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  38.38 
 
 		 530 aa  82.8  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  30.1 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  39.39 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 359 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 533 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 513 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 517 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 515 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  36.7 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  31.58 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 537 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1388  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00534804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 532 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1411  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 337 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.439169  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.4 
 
 		 314 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0013  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 485 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.344073  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0029  DNA-binding transcriptional regulator AraC  35.29 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.773429  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0149  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511163  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0427  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.459699  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1497  AraC family transcription regulator  34 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.141505  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1189  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 550 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.459992  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  31.72 
 
 		 538 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3327  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000116444  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1151  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0648007  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2550  two component transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 502 aa  72.8  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 1201 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 287 aa  72.4  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0853  two component transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 		 509 aa  72  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  36.27 
 
 		 529 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  29.92 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3788  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  30 
 
 		 198 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1731  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.533642 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 233 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  33.66 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3751  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  31.93 
 
 		 198 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000128468 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3585  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  31.93 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3485  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.781082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 532 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3869  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  31.93 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  37.96 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002640  transcriptional regulator AraC family  32.67 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0936  transcriptional regulator, AraC family  24.07 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.352467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  29.09 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1394  two component AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 523 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0042226  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  32.35 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1572  AraC-type DNA-binding protein, response regulator  36.56 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.78 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0827  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000316121  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0219  helix-turn-helix domain-containing protein  27.83 
 
 		 293 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.882333  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 		 282 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1192  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.933136  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3497  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.27794  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  33.33 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 295 aa  68.6  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3619  transcriptional regulator, AraC family  27.36 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.425647 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  30.91 
 
 		 129 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 529 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1094  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0928  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 766 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.197774  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1251  two component transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 		 566 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2264  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.4 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1882  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.4 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3550  transcriptional regulator, AraC family  26.96 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  31.67 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1996  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.4 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03839  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.11 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4188  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4032  transcriptional regulator, AraC family  27.11 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4400  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 283 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.370971  normal  0.467233 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4492  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.494011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5413  transcriptional regulator, AraC family  27.11 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03788  hypothetical protein  27.11 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4062  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  24.48 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3329  hypothetical protein  19.8 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal  0.60626 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1972  AraC family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 701 aa  67  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000433091  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 409 aa  67  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 409 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  26.42 
 
 		 294 aa  67  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>