More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1732 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1732  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 323 aa  664    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0413947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 290 aa  378  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  49.82 
 
 		 303 aa  289  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4426  AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378526 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  24.17 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  26.97 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  26.32 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  26.32 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  26.32 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  26.32 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  24.83 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1667  transcriptional regulator, AraC family  30.24 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  42.16 
 
 		 537 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  32.37 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 		 515 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 539 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5280  transcriptional regulator, AraC family  42.11 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.28 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 533 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 513 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 548 aa  79  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  26.22 
 
 		 519 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 530 aa  77.4  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0219  helix-turn-helix domain-containing protein  24.75 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.882333  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  42 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  35.29 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6523  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.399934 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6111  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.863833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  35.29 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  39 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 266 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  36.73 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  37.76 
 
 		 297 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  33.9 
 
 		 308 aa  75.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  36.46 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0525  two component AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 522 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 259 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5735  transcriptional regulator AraC family  37.5 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  35.34 
 
 		 162 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  36.46 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 133 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 517 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4952  helix-turn-helix domain-containing protein  36.08 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 538 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  34.91 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 112 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 544 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 259 aa  72.4  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 157 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 118 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 168 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.11 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  38.78 
 
 		 1201 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0579  two component AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 531 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3327  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 146 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000116444  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4725  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.70917  normal  0.0655004 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  37.76 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  31.11 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4378  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103943  hitchhiker  0.00146244 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0399  response regulator receiver protein  31.34 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1237  AraC family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000177874  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1710  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.492868 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0835  AraC family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  34.15 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  39.8 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  31.31 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>