More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4074 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 290 aa  603  1.0000000000000001e-171  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1732  AraC family transcriptional regulator  58.62 
 
 		 323 aa  378  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0413947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4415  AraC family transcriptional regulator  54.04 
 
 		 303 aa  324  9e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.0031509  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4426  AraC family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378526 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  26.05 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 		 515 aa  92.8  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2372  regulatory protein PocR  25.73 
 
 		 303 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2259  regulatory protein PocR  25.73 
 
 		 303 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.746184  normal  0.221956 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2159  regulatory protein PocR  25.73 
 
 		 303 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.385139  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2213  regulatory protein PocR  25.73 
 
 		 303 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.639643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2206  regulatory protein PocR  25.73 
 
 		 303 aa  92  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5280  transcriptional regulator, AraC family  45.74 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  36.05 
 
 		 286 aa  87.4  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 530 aa  85.9  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1583  two component AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 533 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.160886  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 537 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 548 aa  83.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4378  transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103943  hitchhiker  0.00146244 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 		 513 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2277  regulatory protein PocR  24.42 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000774305  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  32.85 
 
 		 519 aa  82.4  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 301 aa  82  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0944  two component transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 539 aa  82  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  35.35 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  39.18 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.45 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  36.13 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  36.13 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 538 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  38.14 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1667  transcriptional regulator, AraC family  31.65 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0579  two component AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 531 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 517 aa  79  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3182  AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000265571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3165  helix-turn-helix domain-containing protein  35.59 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00840402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  31.29 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0508  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.3342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  40.4 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  40.4 
 
 		 1201 aa  77  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  36.73 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.11 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  36.11 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0219  helix-turn-helix domain-containing protein  26.91 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.882333  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  37.86 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  39.39 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 319 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00465  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 297 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  29.77 
 
 		 162 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 302 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1639  AraC family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.066752 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 310 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1237  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000177874  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1048  AraC family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 101 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000208047  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4952  helix-turn-helix domain-containing protein  36.08 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017601  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0895  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0737  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.359471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  30.08 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1710  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.492868 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  30.83 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 440 aa  72.8  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  34.29 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0864  two component AraC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 503 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20280  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0229385  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0525  two component AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 522 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  29.31 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  36.73 
 
 		 160 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1886  transcriptional regulator, AraC family  38.95 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  33.33 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>