More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0131 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0131  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 328 aa  668    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0126  transcriptional regulator, AraC family  36.42 
 
 		 326 aa  159  9e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.338176  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2823  AraC family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599889  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  27.24 
 
 		 324 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3261  helix-turn-helix domain-containing protein  47.47 
 
 		 339 aa  89.7  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000231694  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  31.51 
 
 		 330 aa  89.4  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3660  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 332 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.954099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7852  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2046  AraC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 777 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  30.04 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  25.83 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  24.5 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2962  AraC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  25.27 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  23.99 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 339 aa  72.8  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5309  AraC family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 314 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0311783  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  38.52 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4450  transcriptional regulator, AraC family  29.8 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  0.0834018 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2723  helix-turn-helix domain-containing protein  27.21 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  36.67 
 
 		 791 aa  69.7  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  38.54 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  42.35 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  38.54 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  38.54 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3102  AraC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  40.82 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5067  AraC family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1154  AraC family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569492  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  24.45 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  40.82 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0534  transcriptional regulator, AraC family  28.16 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  38.26 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1058  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1452  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 503 aa  65.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2146  transcriptional regulator, AraC family  27.72 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0550  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.713955  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3438  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0480484 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  38.68 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4458  transcriptional regulator, AraC family  33.88 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00884299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4231  AraC family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3050  transcriptional regulator, AraC family  27.98 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0552  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  28.48 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2794  helix-turn-helix domain-containing protein  33.64 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.474523 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  23.05 
 
 		 791 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4103  transcriptional regulator, AraC family  27.48 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.309403 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3990  transcriptional regulator, AraC family  27.48 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.758645 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  36.36 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2585  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 339 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.168038  normal  0.493972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3517  transcriptional regulator, AraC family  25.19 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.74 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 791 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2758  helix-turn-helix domain-containing protein  27.07 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2261  transcriptional regulator, AraC family  25.76 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00485013  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1471  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25.76 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2016  helix-turn-helix, AraC type  27.21 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.775472  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1928  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0979151  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01356  DNA-binding transcriptional dual regulator  25.76 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4958  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1569  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25.76 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2271  DNA-binding transcriptional activator FeaR  25.76 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01369  hypothetical protein  25.76 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0139  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0483554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2213  helix-turn-helix, AraC type  26.48 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.522534  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>