More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3261 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3261  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 339 aa  704    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000231694  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7852  AraC family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 338 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2823  AraC family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 332 aa  90.1  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599889  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0131  transcriptional regulator, AraC family  47.47 
 
 		 328 aa  89.7  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5067  AraC family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 334 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  45.54 
 
 		 324 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 327 aa  79  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 777 aa  77  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1779  AraC family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 311 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.255898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0126  transcriptional regulator, AraC family  42.57 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.338176  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0534  transcriptional regulator, AraC family  29.1 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4410  helix-turn-helix domain-containing protein  30.99 
 
 		 318 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.316774 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.23 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2090  helix-turn-helix domain-containing protein  27.71 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.639887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2794  helix-turn-helix domain-containing protein  36.17 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.474523 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  23.33 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  35.64 
 
 		 791 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 347 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 329 aa  67  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  34.59 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4458  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00884299 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4958  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 165 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4308  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0968012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2885  AraC family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 299 aa  63.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 844 aa  63.5  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3102  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 791 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0180  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 378 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.34579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  27.04 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  34.65 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  33 
 
 		 340 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  30.47 
 
 		 791 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3483  transcriptional regulator, AraC family  25.97 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3660  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.954099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4450  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  0.0834018 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0928  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 766 aa  60.5  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.197774  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2825  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00154924  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 810 aa  59.7  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  29.81 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  30.53 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1695  transcriptional regulator, AraC family  27.76 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.674415  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  21.52 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2481  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 331 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.25538 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3050  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  36.61 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 319 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0324  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.645662 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  31.58 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1928  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 325 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0979151  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1154  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569492  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0498  transcriptional regulator  39.51 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3170  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4563  transcriptional regulator, AraC family  29.59 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.409707 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1604  AraC family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1058  AraC family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3613  AraC family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.350742  normal  0.0515113 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0590  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1666  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 1121 aa  57.8  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2390  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  31.58 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 322 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>