More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4450 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4450  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 314 aa  638    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  0.0834018 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  31.99 
 
 		 319 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  32.24 
 
 		 319 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 319 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 318 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 318 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 318 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  31.99 
 
 		 319 aa  135  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 319 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3834  helix-turn-helix domain-containing protein  29.47 
 
 		 340 aa  125  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  28.02 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5093  AraC family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650203 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5967  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 315 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.953571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 325 aa  97.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 319 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.48 
 
 		 342 aa  96.3  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  27.31 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4494  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 326 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5130  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 326 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5729  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 326 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 367 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2002  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 340 aa  89.7  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3145  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 326 aa  89.7  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  27.54 
 
 		 348 aa  87.4  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3145  AraC family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  29.24 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 791 aa  86.3  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5004  AraC family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 321 aa  86.3  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  28.63 
 
 		 330 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5301  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 326 aa  85.9  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5309  AraC family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0311783  normal  0.649515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 330 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 777 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 791 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4587  transcriptional regulator, AraC family  26.17 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3510  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.64 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120077  normal  0.581367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3050  transcriptional regulator, AraC family  26.49 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  25.73 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  29.71 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4995  AraC family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 339 aa  76.6  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4958  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  28.09 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3137  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.806446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2110  transcriptional regulator, AraC family  29.49 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1604  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2823  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599889  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4762  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  28.57 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  27.7 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 844 aa  73.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7852  AraC family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 338 aa  72.4  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7239  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  27.8 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1928  AraC family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0979151  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  39.83 
 
 		 791 aa  71.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3156  AraC family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3736  AraC family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0131  transcriptional regulator, AraC family  29.8 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3970  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 338 aa  70.5  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.59 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4500  AraC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5123  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2261  transcriptional regulator, AraC family  26.29 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00485013  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  40.74 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4032  DNA-binding transcriptional activator FeaR  23.37 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000774169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01356  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.61 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  40.21 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4458  transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 328 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00884299 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1471  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.29 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1569  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.29 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01369  hypothetical protein  26.61 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2271  DNA-binding transcriptional activator FeaR  26.61 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0619  transcriptional regulator, AraC family  27.65 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0274384 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0608  helix-turn-helix domain-containing protein  27.65 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.896231  normal  0.142741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>