More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5067 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5067  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 334 aa  632  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7852  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 338 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40387  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3261  helix-turn-helix domain-containing protein  30.55 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000231694  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2823  AraC family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.599889  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  50.96 
 
 		 777 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0126  transcriptional regulator, AraC family  51.43 
 
 		 326 aa  97.1  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.338176  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  42.61 
 
 		 791 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0131  transcriptional regulator, AraC family  42.2 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3975  AraC family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0986  AraC family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.613317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3797  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 		 335 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1804  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 316 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0697858 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7635  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  45.74 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1004  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 791 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3516  transcriptional regulator, AraC family  31.06 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673643 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0397  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 327 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2880  AraC family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 336 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.560764 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  30.13 
 
 		 791 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1975  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.998317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2794  helix-turn-helix domain-containing protein  42.35 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.474523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5389  transcriptional regulator, AraC family  34.81 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112757 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4308  AraC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0968012 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10940  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.725025  normal  0.984185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4010  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0994  AraC family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2658  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3229  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0808896  normal  0.115226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1956  AraC family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4078  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0173878  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4288  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 346 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4767  AraC family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.179878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4958  AraC family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 165 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3662  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3027  AraC family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0894472  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4762  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  30.94 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.505446 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0008  helix-turn-helix, AraC type  36.11 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0683899  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0975  transcriptional regulator, AraC family  40.68 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6262  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 352 aa  67  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.330123 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4450  transcriptional regulator, AraC family  37.4 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  0.0834018 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2493  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.470802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6548  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2620  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.72884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4895  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1512  AraC family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 324 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4458  transcriptional regulator, AraC family  29.17 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00884299 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2090  helix-turn-helix domain-containing protein  40.4 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.639887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1031  DNA-binding transcriptional activator FeaR  39.47 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3969  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.806677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1666  AraC/XylS family transcriptional regulator  36 
 
 		 1121 aa  64.7  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2219  DNA-binding transcriptional activator FeaR  35.87 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3660  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.954099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2885  AraC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0306  transcriptional regulator, AraC family  34.96 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.728671  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4563  transcriptional regulator, AraC family  33.94 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.409707 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 844 aa  65.1  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2706  AraC family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129911  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1154  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.569492  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 810 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6347  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1058  AraC family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4851  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2002  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0263  AraC family transcription regulator  35.58 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3143  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 317 aa  63.9  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3279  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.853616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0050  putative transcriptional regulator  35.58 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11240  DNA-binding transcriptional activator FeaR  32.2 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2046  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1165  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2670  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.422994  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5215  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  41.09 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.329333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2709  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.519621  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3284  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1843  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0051  putative transcriptional regulator  34.74 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7818  AraC family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2105  putative sigma54 specific transcriptional regulator  40.45 
 
 		 497 aa  62  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.619214  normal  0.0553697 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2542  transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0044  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3170  transcriptional regulator  43.82 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3504  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0070  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0607  helix-turn-helix domain-containing protein  30.97 
 
 		 348 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0210  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3050  transcriptional regulator, AraC family  35.19 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3881  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.199476 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0382  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 347 aa  60.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.565461  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3576  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3348  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.125863  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38.46 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0984  DNA-binding transcriptional activator FeaR  36.25 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1928  AraC family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0979151  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  52.54 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4347  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.378595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6715  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>