More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2885 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2885  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  601  1.0000000000000001e-171  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  40.31 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3203  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 343 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3942  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 336 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0324  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 383 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.645662 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0180  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.34579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  27.08 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5064  AraC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1138  helix-turn-helix domain-containing protein  33.87 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5220  AraC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.974611 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2607  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334421  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3287  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3303  AraC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2402  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2825  helix-turn-helix domain-containing protein  29.84 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00154924  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2248  helix-turn-helix domain-containing protein  38.95 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3526  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.382139  normal  0.568026 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3261  helix-turn-helix domain-containing protein  43.21 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000231694  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6176  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2227  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1480  transcriptional regulator, AraC family  30.91 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0895908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71170  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2123  two component AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.331776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1001  transcriptional regulator, AraC family  23.14 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0599  transcriptional regulator  40.26 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2367  AraC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.923255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4999  AraC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4474  AraC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0179  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 388 aa  62.4  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0264145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 345 aa  62.4  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5702  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.946416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2888  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0357518  hitchhiker  0.0034345 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3578  AraC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0329  AraC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2150  transcriptional regulator, AraC family  39.73 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28417  normal  0.200659 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  23.21 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3779  AraC family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0505426 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  45 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5229  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.35662  normal  0.0289181 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3613  AraC family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.350742  normal  0.0515113 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4437  transcriptional activator RhaS  25.71 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2310  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.63 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120361  normal  0.040249 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03791  DNA-binding transcriptional activator, L-rhamnose-binding  25.71 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4079  transcriptional regulator, AraC family  25.71 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3835  AraC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3428  transcriptional regulator, AraC family  21.88 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3041  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3690  AraC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5358  transcriptional activator RhaS  25.71 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4135  transcriptional activator RhaS  25.71 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4528  AraC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4112  transcriptional activator RhaS  25.71 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2711  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  42.86 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03740  hypothetical protein  25.71 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2813  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.68 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1867  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.122856  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5636  transcriptional regulator, AraC family  38.64 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7234  transcriptional regulator, AraC family  38.64 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0446957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5388  transcriptional regulator, AraC family  28.3 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.769805 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 513 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5355  AraC family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.924239 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1485  helix-turn-helix domain-containing protein  40.28 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.232503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3170  transcriptional regulator  39.19 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2126  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0536  transcriptional regulator  32 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0848  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4301  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.220521  normal  0.797318 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1850  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.999636  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4903  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1479  transcriptional regulator, AraC family  33.13 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4906  AraC family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209639  hitchhiker  0.0012176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2690  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671467 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0988  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0489  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0759  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1960  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  40.54 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05185  hypothetical protein  32.22 
 
 		 280 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1419  transcriptional regulator  25.18 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0349  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0692  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0829  transcriptional regulator  37.66 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.351289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  33.75 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2123  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0450  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0724332  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0498  transcriptional regulator  41.33 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0070  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3282  two component AraC family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 535 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>