More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0536 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0536  transcriptional regulator  100 
 
 
318 aa  654    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3021  AraC family transcriptional regulator  51.44 
 
 
361 aa  338  5e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.826436 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2462  transcriptional regulator  43.73 
 
 
337 aa  268  8e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0599  transcriptional regulator  38.94 
 
 
326 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3578  AraC family transcriptional regulator  39.27 
 
 
314 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.54425 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5220  AraC family transcriptional regulator  38.94 
 
 
314 aa  219  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.974611 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5064  AraC family transcriptional regulator  38.94 
 
 
314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3303  AraC family transcriptional regulator  38.94 
 
 
314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4999  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 
314 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258482  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4474  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 
314 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4511  transcriptional regulator, AraC family  39.14 
 
 
341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88084  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1960  AraC family transcriptional regulator  38.98 
 
 
314 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0988  AraC family transcriptional regulator  38.98 
 
 
314 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3287  AraC family transcriptional regulator  38.03 
 
 
331 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0759  AraC family transcriptional regulator  38.98 
 
 
314 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0692  AraC family transcriptional regulator  38.98 
 
 
314 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0489  AraC family transcriptional regulator  38.98 
 
 
336 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2126  AraC family transcriptional regulator  38.98 
 
 
361 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0848  AraC family transcriptional regulator  38.98 
 
 
361 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0829  transcriptional regulator  37.94 
 
 
317 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.351289 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1850  AraC family transcriptional regulator  38.28 
 
 
314 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.999636  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  37.75 
 
 
375 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6176  putative transcriptional regulator  36.96 
 
 
336 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 
332 aa  205  7e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  36.3 
 
 
364 aa  205  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71170  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 
336 aa  205  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 
367 aa  205  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001535  transcriptional regulator AraC family  34.98 
 
 
318 aa  203  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  34.08 
 
 
332 aa  202  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 
368 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  36.63 
 
 
367 aa  202  6e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  35.9 
 
 
367 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 
367 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  36.57 
 
 
368 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  36.57 
 
 
368 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  36.96 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  35.1 
 
 
353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  36.57 
 
 
368 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 
332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  34.52 
 
 
368 aa  199  5e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0498  transcriptional regulator  35.86 
 
 
316 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
332 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
332 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2915  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  35.76 
 
 
325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  34.97 
 
 
332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0329  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 
334 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  36.69 
 
 
337 aa  195  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4809  transcriptional regulator  34.65 
 
 
331 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5229  transcriptional regulator  35.1 
 
 
314 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.35662  normal  0.0289181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  32.67 
 
 
332 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1528  transcriptional regulator  35.26 
 
 
335 aa  193  4e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.755279  normal  0.310325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  33.55 
 
 
337 aa  192  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 
332 aa  192  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
332 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 
332 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_003296  RS02043  transcriptional regulator transcription regulator protein  33.33 
 
 
334 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 
332 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 
355 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 
355 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0305  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 
319 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 
339 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0325  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 
315 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3448  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 
325 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  32.91 
 
 
340 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4061  AraC family transcriptional regulator  35.08 
 
 
401 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135508  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4903  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 
315 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 
337 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  33.66 
 
 
337 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  32.58 
 
 
338 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4823  transcriptional regulator  35.26 
 
 
338 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5062  transcriptional regulator, AraC family  34.54 
 
 
331 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652687  normal  0.0215007 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0570  transcriptional regulator  34.85 
 
 
371 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1140  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 
322 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5086  AraC family transcriptional regulator  34.85 
 
 
371 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5199  AraC family transcriptional regulator  34.85 
 
 
341 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3282  AraC family transcriptional regulator  34.85 
 
 
371 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  34.75 
 
 
316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1586  transcriptional regulator  34.54 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3545  AraC family transcriptional regulator  34.85 
 
 
341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4498  AraC family transcriptional regulator  34.2 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2488  AraC family transcriptional regulator  35.31 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  35.64 
 
 
343 aa  183  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 
343 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1111  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 
339 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000893396  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0347  transcriptional regulator, AraC family  35.1 
 
 
322 aa  183  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5023  AraC family transcriptional regulator  34.2 
 
 
341 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3277  AraC family transcriptional regulator  33.12 
 
 
339 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02029  transcriptional regulator transcription regulator protein  34.44 
 
 
343 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.130887 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  32.78 
 
 
334 aa  182  7e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  35.1 
 
 
344 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1869  AraC family transcriptional regulator  34.2 
 
 
341 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3304  AraC family transcriptional regulator  33.76 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176571  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2821  transcriptional regulator  34.54 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3170  transcriptional regulator  33.11 
 
 
327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5693  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 
336 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.114959 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2253  AraC family transcriptional regulator  32.01 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>