More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2821 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2821  transcriptional regulator  100 
 
 		 324 aa  656    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1111  AraC family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 339 aa  314  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000893396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  44.58 
 
 		 375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  46.62 
 
 		 367 aa  270  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 367 aa  269  5e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 368 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 368 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  44.55 
 
 		 367 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 368 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  45.63 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  44.55 
 
 		 367 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3277  AraC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 339 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  45.05 
 
 		 367 aa  259  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 368 aa  259  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0305  AraC family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 319 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0325  AraC family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 315 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4903  AraC family transcriptional regulator  43 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2915  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  43.04 
 
 		 325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 332 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 332 aa  242  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 332 aa  241  9e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 332 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 332 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 332 aa  241  9e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5229  transcriptional regulator  43.04 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.35662  normal  0.0289181 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2488  AraC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  44.01 
 
 		 332 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2238  AraC family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 330 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.390455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0329  AraC family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 314 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3394  transcriptional regulator, AraC family  41.05 
 
 		 334 aa  238  8e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  41.56 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 334 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 355 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 355 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  41.5 
 
 		 332 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1950  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 341 aa  236  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 332 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 332 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4809  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 331 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  41.08 
 
 		 337 aa  235  6e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 337 aa  235  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  40.88 
 
 		 343 aa  235  7e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 332 aa  235  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1831  transcriptional regulator ArgR  42.12 
 
 		 351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3287  AraC family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 331 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1140  AraC family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2912  AraC family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 326 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.299019 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  39.69 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3566  helix-turn-helix, AraC type  41.56 
 
 		 351 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52740  transcriptional regulator ArgR  42.81 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2234  AraC family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 335 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2064  AraC family transcriptional regulator  44.69 
 
 		 335 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3665  AraC family transcriptional regulator  44.69 
 
 		 401 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  normal  0.253179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4621  transcriptional regulator ArgR  42.49 
 
 		 329 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71170  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 336 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4511  transcriptional regulator, AraC family  42.44 
 
 		 341 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6176  putative transcriptional regulator  43.14 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0498  transcriptional regulator  43.27 
 
 		 316 aa  229  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3771  AraC family transcriptional regulator  49.56 
 
 		 326 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.128178  normal  0.013148 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3448  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 325 aa  228  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4482  AraC family transcriptional regulator  50.45 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7695  transcriptional regulator  39.55 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1433  helix-turn-helix domain-containing protein  50.45 
 
 		 326 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.392956  normal  0.582162 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  38.27 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  38.26 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  38.27 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34510  ArgR-like transcriptional regulator, AraC family  42.77 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1850  AraC family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 314 aa  226  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.999636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4287  AraC family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 326 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1557  transcriptional regulator, AraC family  40.91 
 
 		 349 aa  226  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.150137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0829  transcriptional regulator  41.16 
 
 		 317 aa  225  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.351289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3987  AraC family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 326 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1788  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 350 aa  225  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.432014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2924  AraC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 349 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.817827  normal  0.29565 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3170  transcriptional regulator  43.09 
 
 		 327 aa  225  7e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0692  AraC family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 314 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1960  AraC family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 314 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0988  AraC family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 314 aa  225  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0759  AraC family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 314 aa  225  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2126  AraC family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 361 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0848  AraC family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 361 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02043  transcriptional regulator transcription regulator protein  39.62 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0489  AraC family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001535  transcriptional regulator AraC family  37.22 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5064  AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 314 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2126  AraC family transcriptional regulator  39.94 
 
 		 346 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.330362  normal  0.517633 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3303  AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 314 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 332 aa  222  6e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4290  AraC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 347 aa  222  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3578  AraC family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54425 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5220  AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.974611 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1057  AraC family transcriptional regulator  39.94 
 
 		 346 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0171524  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  38.34 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4061  AraC family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 401 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135508  normal  0.429541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>