More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3835 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3690  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4528  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3835  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 257 aa  501  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5558  AraC family transcriptional regulator  92.22 
 
 		 255 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3735  AraC family transcriptional regulator  92.22 
 
 		 255 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  0.587123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2262  AraC family transcriptional regulator  84.82 
 
 		 257 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.302077  normal  0.0338598 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4906  AraC family transcriptional regulator  85.6 
 
 		 256 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.209639  hitchhiker  0.0012176 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0553  AraC family transcriptional regulator  70.66 
 
 		 255 aa  360  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169968  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2613  AraC family transcriptional regulator  70.27 
 
 		 255 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0908  hypothetical protein  69.88 
 
 		 255 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2475  AraC family transcriptional regulator  69.5 
 
 		 255 aa  354  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4383  AraC family transcriptional regulator  68.63 
 
 		 257 aa  346  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6833  transcriptional regulator, AraC family  67.57 
 
 		 259 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.540277 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2872  AraC family transcriptional regulator  66.41 
 
 		 259 aa  325  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4719  AraC family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4881  AraC family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 263 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000645238  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4427  helix-turn-helix domain-containing protein  28.63 
 
 		 257 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22580  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000567306  hitchhiker  0.000118862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1906  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  33.19 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  32.07 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1861  helix-turn-helix domain-containing protein  31.69 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0711253  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0083  transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 240 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1474  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 254 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.109317 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  27.12 
 
 		 259 aa  95.9  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0091  transcriptional regulator, AraC family  32.54 
 
 		 240 aa  95.9  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.994797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1820  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 248 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.167781  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  27.45 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3800  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000600898 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  27.17 
 
 		 270 aa  92  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4017  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173287 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0234  transcription regulator protein  32.42 
 
 		 248 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4511  AraC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0764519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1400  helix-turn-helix domain-containing protein  30.38 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113749  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4042  helix-turn-helix domain-containing protein  29.03 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  39.25 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  44.33 
 
 		 306 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2748  AraC family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3309  AraC family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  39.8 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3166  AraC family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5202  AraC family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0605893 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 326 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6428  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.980502 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6085  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0677  transposon Tn10 TetD protein  38.38 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0634  transposon Tn10 TetD protein  38.38 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0620  transposon Tn10 TetD protein  38.38 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0693  transposon Tn10 TetD protein  38.38 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0739  transposon Tn10 TetD protein  38.38 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0278  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  36.61 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  37.04 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  41 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  40.45 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1506  helix-turn-helix domain-containing protein  22.66 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  38.3 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1078  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 113 aa  68.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.531138 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  28.19 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3602  AraC family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.593194  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0628  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 136 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6477  two component AraC family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  36.61 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1747  transcriptional regulator, AraC family  29.15 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49476  normal  0.0537138 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5986  two component AraC family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0117191 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  35.42 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  34.69 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38.1 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2470  hypothetical protein  24.9 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  31.86 
 
 		 354 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1138  helix-turn-helix domain-containing protein  34.68 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  35.19 
 
 		 319 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 334 aa  67  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5621  two component AraC family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289619  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  36.67 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43580  putative transcriptional regulator  35.35 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.417491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2116  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  35.35 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>