More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2825 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2825  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 320 aa  664    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00154924  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5702  transcriptional regulator, AraC family  66.04 
 
 		 319 aa  459  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.946416 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5692  transcriptional regulator, AraC family  38.64 
 
 		 318 aa  216  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  35.78 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  34.08 
 
 		 326 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2150  transcriptional regulator, AraC family  36.94 
 
 		 314 aa  165  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28417  normal  0.200659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4250  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5371  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0879  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 347 aa  90.1  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1482  transcriptional regulator, AraC family  24.07 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  29.94 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  31.36 
 
 		 310 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2099  yersiniabactin transcriptional regulator YbtA  28.77 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0941  helix-turn-helix domain-containing protein  31.4 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  28.31 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1611  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0430  transcriptional regulator, AraC family  35.92 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3041  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  22.77 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2438  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000013643 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3282  helix-turn-helix domain-containing protein  40.78 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0079  transcriptional regulator, AraC family  23.13 
 
 		 384 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1432  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185359  normal  0.618503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2439  helix-turn-helix domain-containing protein  35.34 
 
 		 322 aa  75.1  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.856689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4823  helix-turn-helix domain-containing protein  33.86 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802517  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6528  two component AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485144  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6762  two component AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0100  AraC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54870  hypothetical protein  32.33 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000873444  unclonable  5.92488e-22 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2397  two component transcriptional regulator, AraC family  32.97 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.92999  normal  0.351016 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6350  two component AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787195  normal  0.900493 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3754  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1575  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38.38 
 
 		 325 aa  71.6  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000250184  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4270  helix-turn-helix domain-containing protein  29.41 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0674  transcriptional regulator, AraC family  30.57 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12970  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  26.21 
 
 		 306 aa  70.5  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.149965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6199  transcriptional regulator, AraC family  24.11 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.224199  normal  0.145897 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 760 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0450  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0724332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2126  transcriptional regulator, AraC family  23.46 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000362922  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1439  transcriptional regulator, AraC family  34.26 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.257773  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0803  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0432  AraC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 350 aa  69.7  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1197  transcriptional regulator, AraC family  26 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00505676  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7173  two component AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.495812 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2914  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0441  transcriptional regulator  37.27 
 
 		 188 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.586724  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  29.69 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0862  AraC family transcription regulator  30 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812854  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6071  two component AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 154 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0029  DNA-binding transcriptional regulator AraC  34.07 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.773429  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6368  two component AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.45 
 
 		 156 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1473  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.67 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.844163  normal  0.308396 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7234  transcriptional regulator, AraC family  41.56 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0446957 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0328  transcriptional regulator, AraC family  24.48 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1500  helix-turn-helix domain-containing protein  41.46 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.546441  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 290 aa  67  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2606  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177671  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0873  transcriptional regulator PchR  32.69 
 
 		 295 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1106  AraC family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 388 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1123  AraC family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 361 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.408169  normal  0.947213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09260  transcriptional regulator PchR  32.69 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.372084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1122  AraC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1107  AraC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 398 aa  67  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 532 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  34.04 
 
 		 1370 aa  66.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0862  AraC family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185798  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2367  AraC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.923255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4321  helix-turn-helix domain-containing protein  30.48 
 
 		 357 aa  65.9  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  39.76 
 
 		 1388 aa  65.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3170  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 344 aa  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5636  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2338  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.438045  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3259  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 332 aa  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.560164  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3368  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.325017  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3316  helix-turn-helix domain-containing protein  35.96 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606896  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1147  AraC family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 311 aa  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4999  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0916348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2581  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0247972  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2960  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0671  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  31.52 
 
 		 537 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2462  transcriptional regulator  30.71 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2885  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0590  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1140  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4205  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.382392 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5747  transcriptional regulator AraC family  32.61 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807364  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>