More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1482 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1482  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 345 aa  711    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0328  transcriptional regulator, AraC family  32.89 
 
 		 323 aa  95.5  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1770  transcriptional regulator, AraC family  27.37 
 
 		 320 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0920  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 313 aa  86.3  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0175793  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0308  transcriptional regulator, AraC family  25.32 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2825  helix-turn-helix domain-containing protein  23.1 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00154924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 537 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 530 aa  73.6  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3237  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.434177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 332 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0499  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811586 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6660  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  30.63 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2943  helix-turn-helix domain-containing protein  30.43 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0314532  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1432  transcriptional regulator, AraC family  27.57 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185359  normal  0.618503 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  29.91 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0731  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.617247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2813  transcriptional regulator, AraC family  37.27 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0432  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0681  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4307  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  27.67 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0841  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  28.99 
 
 		 331 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002640  transcriptional regulator AraC family  30 
 
 		 241 aa  67  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.632133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  27.74 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06471  hypothetical protein  29.27 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00477  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  31.4 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1040  transcriptional regulator, AraC family  41.77 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2225  AraC family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.120601  normal  0.705003 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  29.1 
 
 		 321 aa  65.9  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 338 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  29.29 
 
 		 241 aa  65.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 304 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2436  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0579  two component AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 531 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5487  transcriptional regulator, AraC family  26.25 
 
 		 275 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2770  helix-turn-helix domain-containing protein  25.7 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03421  DNA-binding transcriptional activator, xylose-binding  27.72 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.684991  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  26.76 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0141  transcriptional regulator, AraC family  27.72 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4945  xylose operon regulatory protein  27.72 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.462654  normal  0.028978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3892  xylose operon regulatory protein  27.72 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3772  xylose operon regulatory protein  27.72 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5462  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  32.5 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4065  xylose operon regulatory protein  27.72 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0145  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7439  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3546  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776433  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03372  hypothetical protein  27.72 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716193  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38040  AraC family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110886  hitchhiker  0.0035496 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4821  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535496  normal  0.116549 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  21.91 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  29.38 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 760 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  30.77 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3953  xylose operon regulatory protein  27.72 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0064  transcriptional regulator, AraC family  28.46 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0626  AraC family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.653952  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 133 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0152  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4971  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0504817  hitchhiker  0.0000000000361988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3782  AraC family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0502919 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4384  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.7748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5065  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.289747  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  28.08 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5795  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  24.16 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  24.52 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3606  AraC-like transcriptional regulator  27.46 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  33.01 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3115  helix-turn-helix domain-containing protein  28.19 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1549  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0143415  hitchhiker  0.00302933 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2415  transcriptional regulator, AraC family  30.36 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125553 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1455  AraC-type DNA-binding protein, response regulator  27.96 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  31 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0526  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1083  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  37.66 
 
 		 1374 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0102  AraC family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>