More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0102 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03421  DNA-binding transcriptional activator, xylose-binding  81.79 
 
 		 392 aa  673    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.684991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0141  transcriptional regulator, AraC family  81.79 
 
 		 392 aa  673    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3876  xylose operon regulatory protein  79.69 
 
 		 392 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4065  xylose operon regulatory protein  81.79 
 
 		 392 aa  673    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4432  transcriptional regulator, AraC family  84.73 
 
 		 392 aa  700    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3940  xylose operon regulatory protein  79.69 
 
 		 392 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.688005 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0060  AraC family transcriptional regulator  86.15 
 
 		 397 aa  710    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4045  xylose operon regulatory protein  79.69 
 
 		 392 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.654241  normal  0.387961 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0082  transcriptional regulator, AraC family  82.19 
 
 		 395 aa  672    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.719713  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3985  xylose operon regulatory protein  79.69 
 
 		 392 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3772  xylose operon regulatory protein  81.79 
 
 		 392 aa  673    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3953  xylose operon regulatory protein  81.79 
 
 		 392 aa  673    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0145  AraC family transcriptional regulator  81.79 
 
 		 392 aa  673    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0064  transcriptional regulator, AraC family  84.22 
 
 		 409 aa  695    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3859  xylose operon regulatory protein  79.69 
 
 		 392 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3892  xylose operon regulatory protein  81.79 
 
 		 392 aa  673    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4098  xylose operon regulatory protein  86.15 
 
 		 397 aa  710    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03372  hypothetical protein  81.79 
 
 		 392 aa  673    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716193  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0152  AraC family transcriptional regulator  80.77 
 
 		 392 aa  665    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0102  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 392 aa  816    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4151  transcriptional regulator, AraC family  84.73 
 
 		 392 aa  698    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4155  xylose operon regulatory protein  86.15 
 
 		 397 aa  710    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.664411  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4945  xylose operon regulatory protein  81.79 
 
 		 392 aa  673    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.462654  normal  0.028978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3724  AraC family transcriptional regulator  56.81 
 
 		 390 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0794  AraC family transcriptional regulator  61.68 
 
 		 387 aa  491  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1869  helix-turn-helix domain-containing protein  56.52 
 
 		 393 aa  486  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.713108 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2343  AraC family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 414 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6330  AraC family transcriptional regulator  48.56 
 
 		 397 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.768767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6634  transcriptional regulator, AraC family  49.09 
 
 		 405 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.903716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4206  AraC family transcriptional regulator  48.29 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4185  transcriptional regulator, AraC family  47.79 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2623  AraC family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 405 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.242365 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4073  transcriptional regulator, AraC family  47.79 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6507  AraC family transcriptional regulator  48.29 
 
 		 397 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6741  AraC family transcriptional regulator  48.29 
 
 		 397 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15092  normal  0.533175 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2882  helix-turn-helix, AraC type:periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  47.88 
 
 		 399 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677365  normal  0.592102 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2337  xylose operon regluatory protein  47.24 
 
 		 397 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247833  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3001  xylose operon regluatory protein  47.88 
 
 		 395 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.282498  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6331  AraC family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 397 aa  362  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6031  AraC family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 397 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2304  AraC family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 391 aa  362  9e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0753369  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0774  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.67 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2801  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.85 
 
 		 386 aa  200  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.749326  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0800  transcriptional regulator, AraC family  29.74 
 
 		 401 aa  179  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315678 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3035  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.78 
 
 		 380 aa  177  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0156  AraC family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3765  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0713818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2316  AraC family transcriptional regulator  30.75 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0587517  normal  0.0445967 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1793  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6583  transcriptional regulator, AraC family  27.37 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3906  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.82 
 
 		 409 aa  152  8e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4330  transcriptional regulator, AraC family  25.06 
 
 		 386 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3229  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 411 aa  140  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  30.51 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3203  transcriptional regulator  33.65 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3942  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 322 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.67 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  31.13 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0841  transcriptional regulator, AraC family  31.54 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5038  transcriptional regulator LacI family  26 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  30.7 
 
 		 337 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2358  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.738853  normal  0.890173 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  30.85 
 
 		 274 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  30.82 
 
 		 1370 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0442  hypothetical protein  30.56 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  30.23 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  28.79 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0197  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160748  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 760 aa  64.3  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  28.79 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4153  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24804 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  25.93 
 
 		 355 aa  64.3  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  29.31 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0120  LacI family transcription regulator  28.11 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.69 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2248  DNA-binding transcriptional regulator AraC  28.79 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211757 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0621  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1537  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  31.02 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  26.42 
 
 		 326 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 345 aa  62  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2680  alanine racemase  25.54 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.769144  normal  0.967228 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2634  DNA-binding transcriptional regulator AraC  29.46 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1482  transcriptional regulator, AraC family  26.53 
 
 		 345 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2961  transcriptional regulator, AraC family  30.91 
 
 		 255 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0159613  hitchhiker  0.000452365 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0876  transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1051  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  31 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6981  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0671274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1506  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570084  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.69 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3607  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>