More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0911 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 332 aa  669    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  47.01 
 
 		 336 aa  319  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  47.56 
 
 		 338 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  41.74 
 
 		 339 aa  277  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  43.94 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  36.56 
 
 		 341 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  39.51 
 
 		 329 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.22 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00410  transcriptional regulator, LacI family  37.43 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  36.12 
 
 		 337 aa  232  6e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  35.35 
 
 		 336 aa  225  8e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  35.44 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  37.61 
 
 		 339 aa  223  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  38.25 
 
 		 334 aa  223  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.61 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  39.56 
 
 		 343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.47 
 
 		 330 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  33.84 
 
 		 335 aa  209  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  37.09 
 
 		 343 aa  208  9e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  33.64 
 
 		 333 aa  206  3e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.64 
 
 		 333 aa  206  4e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  37.69 
 
 		 332 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  33.23 
 
 		 355 aa  203  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  34.13 
 
 		 347 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.84 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  37.39 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.54 
 
 		 332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  32.53 
 
 		 332 aa  199  6e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6650  transcriptional regulator, LacI family  38.73 
 
 		 364 aa  199  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  37.2 
 
 		 344 aa  198  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  37.94 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1598  LacI family transcription regulator  31.23 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0971431  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  34.39 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1069  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  35.44 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.209088 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  32.93 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4438  transcriptional regulator, LacI family  40.13 
 
 		 342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0401839 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  37.08 
 
 		 391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  32.93 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  35.63 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  32.93 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  32.93 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0588  LacI family transcription regulator  35.44 
 
 		 328 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.979882  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  36.23 
 
 		 351 aa  196  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0527  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  35.44 
 
 		 328 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  36.58 
 
 		 347 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  33.23 
 
 		 332 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.62 
 
 		 332 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  37.28 
 
 		 346 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  32.93 
 
 		 332 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  32.93 
 
 		 332 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  32.93 
 
 		 332 aa  195  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  32.93 
 
 		 332 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  38.14 
 
 		 473 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  39.52 
 
 		 343 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  37.28 
 
 		 346 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  37.16 
 
 		 353 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.73 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  34.03 
 
 		 335 aa  193  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  34.08 
 
 		 341 aa  193  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  34.53 
 
 		 386 aa  193  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  35.05 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.72 
 
 		 331 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  37.24 
 
 		 346 aa  192  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.12 
 
 		 337 aa  192  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  38.21 
 
 		 338 aa  192  6e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  37.35 
 
 		 353 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  35.11 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  34.43 
 
 		 341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  34.43 
 
 		 341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.43 
 
 		 343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  34.74 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.43 
 
 		 341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  34.74 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.43 
 
 		 341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  34.43 
 
 		 341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.94 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.43 
 
 		 343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.43 
 
 		 341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  36.53 
 
 		 339 aa  189  4e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  36.69 
 
 		 340 aa  189  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 346 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  34.85 
 
 		 323 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.93 
 
 		 342 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  36.83 
 
 		 349 aa  189  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  33.33 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  34.55 
 
 		 323 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  34.04 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  31.64 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3965  Alanine racemase  38.86 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.578436 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  32.44 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.23 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.64 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  37.61 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  34.55 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  34.55 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 342 aa  186  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  33.12 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  34.55 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>