More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0161 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  100 
 
 		 336 aa  679    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  48.31 
 
 		 355 aa  322  8e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  50.74 
 
 		 335 aa  317  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  45.05 
 
 		 329 aa  299  6e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  48.66 
 
 		 342 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  43.41 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.9 
 
 		 330 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  43.41 
 
 		 332 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  43.41 
 
 		 332 aa  280  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  43.41 
 
 		 332 aa  279  5e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  42.38 
 
 		 337 aa  279  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  43.41 
 
 		 332 aa  279  6e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  43.11 
 
 		 332 aa  278  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  44.51 
 
 		 339 aa  278  9e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  43.11 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  43.11 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  41.28 
 
 		 348 aa  276  4e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  41.87 
 
 		 332 aa  275  9e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  42.51 
 
 		 332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  41.62 
 
 		 332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  44.55 
 
 		 333 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  42.51 
 
 		 332 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  42.51 
 
 		 332 aa  273  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  45.59 
 
 		 342 aa  273  3e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.84 
 
 		 337 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  46.13 
 
 		 340 aa  272  7e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  43.54 
 
 		 332 aa  272  7e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  41.69 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  40.72 
 
 		 333 aa  271  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  45.05 
 
 		 338 aa  270  4e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  40.54 
 
 		 330 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  41.74 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  41.54 
 
 		 346 aa  265  7e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  41.25 
 
 		 346 aa  265  8e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  42.26 
 
 		 332 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  41.96 
 
 		 332 aa  259  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  39.16 
 
 		 334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  38.6 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  39.1 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  39.1 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  37.95 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  39.1 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  39.1 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  39.35 
 
 		 347 aa  256  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1598  LacI family transcription regulator  44.11 
 
 		 333 aa  256  3e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0971431  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  38.69 
 
 		 343 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  38.69 
 
 		 343 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  42.34 
 
 		 341 aa  255  6e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  38.69 
 
 		 343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  38.81 
 
 		 353 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  38.62 
 
 		 343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  38.81 
 
 		 343 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  38.81 
 
 		 343 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  38.81 
 
 		 343 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  39.04 
 
 		 348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  38.81 
 
 		 343 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  36.14 
 
 		 336 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  40.06 
 
 		 331 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  37.61 
 
 		 346 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  38.05 
 
 		 346 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  39.09 
 
 		 353 aa  249  5e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  39.82 
 
 		 333 aa  249  5e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  39 
 
 		 336 aa  249  5e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.12 
 
 		 333 aa  248  9e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  40.72 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  39.46 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  41.39 
 
 		 323 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  40.24 
 
 		 338 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  41.39 
 
 		 323 aa  246  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  41.49 
 
 		 343 aa  246  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  39.23 
 
 		 340 aa  247  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  41.39 
 
 		 323 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  41.69 
 
 		 323 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  40.06 
 
 		 357 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  36.9 
 
 		 337 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  41.39 
 
 		 323 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  41.39 
 
 		 323 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  41.69 
 
 		 323 aa  245  9e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  41.39 
 
 		 323 aa  245  9e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  38.21 
 
 		 333 aa  245  9e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  40.36 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  41.09 
 
 		 323 aa  243  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  39.16 
 
 		 338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  41.09 
 
 		 323 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3632  transcriptional regulator, LacI family  40.75 
 
 		 340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  37.72 
 
 		 334 aa  242  7.999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0226  LacI family transcription regulator  37.8 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00440  transcriptional regulator, LacI family  39.94 
 
 		 338 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  42.31 
 
 		 337 aa  240  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  40.79 
 
 		 336 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.61 
 
 		 323 aa  239  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  37.31 
 
 		 334 aa  239  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 342 aa  239  5.999999999999999e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  36.31 
 
 		 337 aa  238  9e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  37.76 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1481  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.13 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  38.46 
 
 		 339 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  39.21 
 
 		 339 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  41.02 
 
 		 335 aa  236  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>