More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Moth_2273 on replicon NC_007644
Organism: Moorella thermoacetica ATCC 39073



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 333 aa  675    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.41 
 
 		 336 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.07 
 
 		 337 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  43.54 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  43.77 
 
 		 355 aa  258  8e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.92 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40 
 
 		 339 aa  249  6e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  44.18 
 
 		 353 aa  249  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  41.44 
 
 		 329 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  41.21 
 
 		 342 aa  247  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  43.49 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  39.4 
 
 		 332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  39.4 
 
 		 332 aa  245  8e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  41.57 
 
 		 338 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  39.4 
 
 		 332 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  39.4 
 
 		 332 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  39.4 
 
 		 332 aa  242  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  39.1 
 
 		 332 aa  243  5e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  39.1 
 
 		 332 aa  243  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  39.1 
 
 		 332 aa  243  5e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  39.7 
 
 		 332 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  41.69 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  39.1 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  39.1 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  42.26 
 
 		 343 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  40.54 
 
 		 335 aa  239  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  44.13 
 
 		 343 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  44.13 
 
 		 343 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  44.13 
 
 		 343 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  41.44 
 
 		 332 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  44.23 
 
 		 342 aa  238  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  40.58 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  41.23 
 
 		 343 aa  235  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  43.81 
 
 		 343 aa  235  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  41.23 
 
 		 343 aa  235  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  40.26 
 
 		 332 aa  235  8e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  44.05 
 
 		 346 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  40.3 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  41.89 
 
 		 343 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  41.89 
 
 		 343 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  41.3 
 
 		 343 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  41.89 
 
 		 343 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  40.42 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  44.35 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  43.73 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  41.89 
 
 		 343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  40.72 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  40.06 
 
 		 335 aa  233  5e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  40.24 
 
 		 348 aa  233  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  39.35 
 
 		 331 aa  232  6e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  39.34 
 
 		 336 aa  232  8.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  41.64 
 
 		 347 aa  232  9e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  39.34 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  40.29 
 
 		 338 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  39.64 
 
 		 337 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  36.75 
 
 		 331 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.69 
 
 		 342 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.69 
 
 		 342 aa  230  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  41.59 
 
 		 346 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  37.95 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  44.35 
 
 		 357 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  38.99 
 
 		 330 aa  228  8e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.91 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.43 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  41.32 
 
 		 338 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  41.79 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  39.7 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2456  LacI family transcription regulator  40.65 
 
 		 352 aa  227  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  42.22 
 
 		 346 aa  226  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  40.71 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  41.08 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.55 
 
 		 341 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.55 
 
 		 341 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.55 
 
 		 341 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.55 
 
 		 341 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.55 
 
 		 341 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.1 
 
 		 342 aa  222  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  38.25 
 
 		 333 aa  222  6e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  41.85 
 
 		 330 aa  222  8e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  41.85 
 
 		 330 aa  222  8e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  41.85 
 
 		 330 aa  222  8e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  41.09 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  37.8 
 
 		 334 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  40.29 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  41.53 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  41.85 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  39.46 
 
 		 341 aa  219  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03639  DNA-binding transcriptional repressor of ribose metabolism  41.53 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00237415  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03584  hypothetical protein  41.53 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00148852  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  39.47 
 
 		 334 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 342 aa  218  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  37.61 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  40.84 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.97 
 
 		 352 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0182  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.76 
 
 		 347 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  38.1 
 
 		 341 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.1 
 
 		 341 aa  216  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.1 
 
 		 343 aa  216  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.1 
 
 		 341 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.1 
 
 		 343 aa  216  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>