More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3721 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  100 
 
 		 350 aa  695    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3491  transcriptional regulator, LacI family  66.76 
 
 		 349 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.201292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  50.59 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  47.67 
 
 		 335 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4021  transcriptional regulator, LacI family  48.01 
 
 		 350 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613602  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  48.25 
 
 		 344 aa  269  5e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  46.2 
 
 		 338 aa  269  5.9999999999999995e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  46.11 
 
 		 348 aa  268  8.999999999999999e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  47.2 
 
 		 361 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  45.19 
 
 		 340 aa  264  2e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  45.4 
 
 		 348 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  45.53 
 
 		 340 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7169  transcriptional repressor RbsR  48.4 
 
 		 331 aa  258  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351473 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  45.93 
 
 		 473 aa  258  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  47.67 
 
 		 346 aa  257  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1878  transcriptional regulator, LacI family  48.1 
 
 		 351 aa  256  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0941149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08380  transcriptional regulator  43.29 
 
 		 351 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.689367  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  45.45 
 
 		 343 aa  251  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  45.32 
 
 		 344 aa  249  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  45.03 
 
 		 335 aa  246  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2841  transcriptional regulator, LacI family  46.2 
 
 		 345 aa  245  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  45.32 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5334  transcriptional regulator, LacI family  47.23 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.431046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  43.35 
 
 		 343 aa  239  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0403  transcriptional regulator, LacI family  44.41 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3965  Alanine racemase  45.91 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.578436 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  44.28 
 
 		 339 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  41.69 
 
 		 337 aa  226  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03890  transcriptional regulator, LacI family  40.29 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3030  transcriptional regulator, LacI family  42.06 
 
 		 342 aa  222  8e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  42.48 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  38.82 
 
 		 338 aa  216  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  43.53 
 
 		 357 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5673  transcriptional regulator, LacI family  42.11 
 
 		 343 aa  212  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227027  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2615  transcriptional regulator, LacI family  43.4 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3075  transcriptional regulator, LacI family  42.86 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0307  transcriptional regulator, LacI family  39.19 
 
 		 337 aa  207  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.211089  normal  0.109292 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1193  transcriptional regulator, LacI family  41.18 
 
 		 335 aa  205  9e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6684  transcriptional regulator, LacI family  43.79 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.594008 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  38.01 
 
 		 332 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04030  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  35.09 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  37.61 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0566  transcriptional regulator, LacI family  31.9 
 
 		 328 aa  182  6e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.14 
 
 		 336 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20430  transcriptional regulator  39.36 
 
 		 337 aa  179  8e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  32.75 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  34.12 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  32.75 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  31.96 
 
 		 328 aa  172  9e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  33.82 
 
 		 368 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0944  transcriptional regulator, LacI family  38.64 
 
 		 334 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  31.96 
 
 		 338 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  34.31 
 
 		 353 aa  168  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.46 
 
 		 336 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  34.04 
 
 		 353 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  34.4 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  34.31 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  30.12 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002667  Galactose operon repressor  34.5 
 
 		 332 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  34.15 
 
 		 336 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 		 339 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.53 
 
 		 330 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  34.68 
 
 		 349 aa  162  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.85 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.67 
 
 		 342 aa  162  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 		 329 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0861  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.07 
 
 		 292 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.19022 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1396  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.188133  hitchhiker  0.000600717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  30.99 
 
 		 352 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0734  transcriptional regulator, LacI family  35.39 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  36.89 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  30.55 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  34.12 
 
 		 334 aa  160  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  29.15 
 
 		 347 aa  160  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14260  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419378  normal  0.681325 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  30.99 
 
 		 337 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  36.86 
 
 		 336 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1710  LacI family transcription regulator  35.24 
 
 		 344 aa  159  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4592  LacI family transcription regulator  34.22 
 
 		 327 aa  159  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2511  transcriptional regulator, LacI family  36.44 
 
 		 334 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13210  transcriptional regulator, LacI family  29.51 
 
 		 345 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  31.61 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  32.55 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.72 
 
 		 337 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  32.75 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 		 346 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5547  LacI family transcription regulator  34.48 
 
 		 342 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0141  transcriptional regulator, LacI family  36.47 
 
 		 352 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  31.61 
 
 		 341 aa  156  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  31.2 
 
 		 332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  29.97 
 
 		 342 aa  156  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4293  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.2 
 
 		 342 aa  156  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.719683 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3709  galactose operon repressor  30.79 
 
 		 333 aa  155  7e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.88 
 
 		 335 aa  155  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  32.6 
 
 		 323 aa  155  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  32.17 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  32.17 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>