More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2511 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  100 
 
 
346 aa  699    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0187  transcriptional regulator, LacI family  76.95 
 
 
339 aa  505  9.999999999999999e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  44.28 
 
 
342 aa  265  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  41.44 
 
 
342 aa  258  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.67 
 
 
330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.65 
 
 
336 aa  248  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  39.64 
 
 
347 aa  239  5e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  43.69 
 
 
326 aa  236  6e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  37.72 
 
 
348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.06 
 
 
356 aa  233  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.39 
 
 
352 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.95 
 
 
335 aa  229  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  40.06 
 
 
334 aa  228  8e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  40.41 
 
 
346 aa  226  4e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  38.53 
 
 
337 aa  222  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  36.12 
 
 
335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  36.94 
 
 
332 aa  219  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3984  transcriptional regulator, LacI family  41.03 
 
 
336 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  36.94 
 
 
332 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  36.62 
 
 
332 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  37.01 
 
 
352 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  36.62 
 
 
332 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.42 
 
 
335 aa  217  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  36.62 
 
 
332 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  36.62 
 
 
332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  37.09 
 
 
332 aa  216  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  35.99 
 
 
332 aa  216  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  36.62 
 
 
332 aa  216  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  36.31 
 
 
332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  36.31 
 
 
332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  38.14 
 
 
330 aa  215  9e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  38.42 
 
 
335 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  37.2 
 
 
344 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  39.26 
 
 
343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  38.06 
 
 
361 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  41.94 
 
 
333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  35.99 
 
 
332 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  39.88 
 
 
342 aa  213  5.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  40.42 
 
 
353 aa  212  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.18 
 
 
335 aa  212  7.999999999999999e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.07 
 
 
338 aa  211  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  41.32 
 
 
349 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  39.7 
 
 
330 aa  211  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.8 
 
 
342 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  41.48 
 
 
331 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.8 
 
 
342 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  38.14 
 
 
353 aa  210  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  37.28 
 
 
343 aa  208  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  34.53 
 
 
333 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.52 
 
 
337 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  38.39 
 
 
330 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  36.31 
 
 
329 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  37.69 
 
 
348 aa  206  7e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  38.81 
 
 
334 aa  206  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  35.71 
 
 
337 aa  205  8e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  38.6 
 
 
338 aa  205  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 
339 aa  205  8e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.88 
 
 
339 aa  205  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2503  transcriptional regulator  32.93 
 
 
339 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  37.24 
 
 
332 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1005  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 
336 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  37.69 
 
 
336 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  37.46 
 
 
337 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  39.22 
 
 
342 aa  203  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  38.15 
 
 
346 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  38.71 
 
 
340 aa  203  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  38.44 
 
 
346 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  38.81 
 
 
334 aa  202  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  36.13 
 
 
331 aa  202  9e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.31 
 
 
342 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  38.69 
 
 
333 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2311  transcriptional regulator, LacI family  35.76 
 
 
335 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000106518  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  36.97 
 
 
368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  37.54 
 
 
353 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3025  transcriptional regulator, LacI family  38.32 
 
 
347 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  37.64 
 
 
391 aa  199  5e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  37.13 
 
 
338 aa  198  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  36.56 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.23 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  34.74 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  35.52 
 
 
332 aa  197  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  36.06 
 
 
323 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.25 
 
 
333 aa  197  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  36.95 
 
 
347 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  34.14 
 
 
341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  35.76 
 
 
323 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.06 
 
 
323 aa  196  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  37.57 
 
 
333 aa  196  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  35.22 
 
 
332 aa  196  7e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  37.54 
 
 
339 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  35.59 
 
 
355 aa  195  9e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  37.61 
 
 
354 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1574  transcriptional regulator, LacI family  37.93 
 
 
337 aa  195  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  36.83 
 
 
340 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  36.06 
 
 
323 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  35.93 
 
 
340 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  35.76 
 
 
323 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  34.77 
 
 
343 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3795  DNA-binding transcriptional regulator CytR  36.52 
 
 
356 aa  194  2e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  36.23 
 
 
340 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>