More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1708 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 342 aa  684    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  49.56 
 
 		 342 aa  293  4e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.96 
 
 		 352 aa  291  9e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  43.03 
 
 		 348 aa  290  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  44.68 
 
 		 332 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  42.26 
 
 		 347 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  41.54 
 
 		 346 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  46.36 
 
 		 336 aa  280  4e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  43.6 
 
 		 333 aa  279  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  41.25 
 
 		 346 aa  279  6e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  42.56 
 
 		 343 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  39.22 
 
 		 333 aa  273  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  40.24 
 
 		 334 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  41.79 
 
 		 347 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  43.28 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  41.44 
 
 		 343 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.76 
 
 		 356 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  41.74 
 
 		 343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  42.77 
 
 		 343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  41.74 
 
 		 343 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  40.65 
 
 		 353 aa  266  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  42.77 
 
 		 343 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  42.77 
 
 		 343 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  42.77 
 
 		 343 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  41.14 
 
 		 343 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  41.14 
 
 		 343 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  41.14 
 
 		 343 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  41.14 
 
 		 343 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 346 aa  265  8.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  40.84 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  42.3 
 
 		 335 aa  263  4e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.62 
 
 		 337 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  42.25 
 
 		 334 aa  259  4e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  41.64 
 
 		 331 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  41.39 
 
 		 357 aa  258  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  41.46 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  38.62 
 
 		 334 aa  258  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  40.6 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  40.9 
 
 		 368 aa  257  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1913  DNA-binding transcriptional repressor PurR  40.36 
 
 		 341 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000592501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1526  DNA-binding transcriptional repressor PurR  40.36 
 
 		 341 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1563  DNA-binding transcriptional repressor PurR  40.36 
 
 		 341 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00208837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  38.14 
 
 		 336 aa  256  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  40.55 
 
 		 338 aa  256  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  40.12 
 
 		 346 aa  256  6e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1744  DNA-binding transcriptional repressor PurR  40.06 
 
 		 341 aa  255  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000285436  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1540  DNA-binding transcriptional repressor PurR  40.06 
 
 		 341 aa  255  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000065632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  38.79 
 
 		 334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.17 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  38.99 
 
 		 346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  41.82 
 
 		 333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  39.76 
 
 		 333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.02 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  39.47 
 
 		 346 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  40.48 
 
 		 326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  43.24 
 
 		 338 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  39.34 
 
 		 340 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  35.8 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  40.06 
 
 		 341 aa  250  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.34 
 
 		 335 aa  251  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  41.49 
 
 		 340 aa  250  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  40.06 
 
 		 341 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  40.06 
 
 		 341 aa  250  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  40.06 
 
 		 341 aa  250  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  39.76 
 
 		 338 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  39.46 
 
 		 338 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  40.06 
 
 		 341 aa  250  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  40.06 
 
 		 341 aa  250  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  40.06 
 
 		 341 aa  250  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  38.3 
 
 		 334 aa  250  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  40.06 
 
 		 341 aa  250  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  40.06 
 
 		 341 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  39.64 
 
 		 337 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  42.65 
 
 		 337 aa  249  4e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  41.27 
 
 		 332 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.94 
 
 		 342 aa  248  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  40 
 
 		 341 aa  249  7e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  41.62 
 
 		 336 aa  248  7e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.94 
 
 		 342 aa  248  7e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1789  DNA-binding transcriptional repressor PurR  40.06 
 
 		 341 aa  248  8e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0286691 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  40.96 
 
 		 332 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0187  transcriptional regulator, LacI family  41.67 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  40.36 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  40.66 
 
 		 341 aa  248  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  40.96 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  40.66 
 
 		 341 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  40.66 
 
 		 341 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  40.96 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  40.96 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  40.18 
 
 		 349 aa  246  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  39.27 
 
 		 334 aa  246  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  37.99 
 
 		 333 aa  246  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  39.34 
 
 		 340 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.76 
 
 		 330 aa  246  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  38.79 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  38.48 
 
 		 332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  43.77 
 
 		 355 aa  246  4.9999999999999997e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  38.48 
 
 		 332 aa  246  6e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  39.64 
 
 		 337 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  39.63 
 
 		 353 aa  245  8e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>