More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2402 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 
346 aa  679    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4021  transcriptional regulator, LacI family  60.83 
 
 
350 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613602  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1878  transcriptional regulator, LacI family  63.52 
 
 
351 aa  368  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0941149  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2841  transcriptional regulator, LacI family  59.71 
 
 
345 aa  364  1e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08380  transcriptional regulator  58.79 
 
 
351 aa  354  1e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.689367  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2615  transcriptional regulator, LacI family  60.9 
 
 
337 aa  324  2e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0403  transcriptional regulator, LacI family  54.34 
 
 
350 aa  323  3e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5334  transcriptional regulator, LacI family  54.09 
 
 
339 aa  312  4.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.431046 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  52.24 
 
 
340 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  49.7 
 
 
348 aa  290  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  48.95 
 
 
344 aa  288  9e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  48.37 
 
 
339 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  48.02 
 
 
343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  50.3 
 
 
343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  47.89 
 
 
335 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  52.11 
 
 
331 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3965  Alanine racemase  51.49 
 
 
338 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.578436 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  47.92 
 
 
348 aa  280  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  47.79 
 
 
340 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  48.66 
 
 
473 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  51.05 
 
 
335 aa  272  8.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  48.95 
 
 
339 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  47.32 
 
 
338 aa  267  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  48.8 
 
 
335 aa  267  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  49.26 
 
 
344 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7169  transcriptional repressor RbsR  50.6 
 
 
331 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0351473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  47.67 
 
 
350 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  47.63 
 
 
361 aa  248  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3491  transcriptional regulator, LacI family  45.69 
 
 
349 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.201292  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5673  transcriptional regulator, LacI family  47.48 
 
 
343 aa  245  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227027  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03890  transcriptional regulator, LacI family  41.98 
 
 
337 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  45.48 
 
 
357 aa  232  9e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  41.69 
 
 
338 aa  230  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0307  transcriptional regulator, LacI family  42.63 
 
 
337 aa  225  9e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.211089  normal  0.109292 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3030  transcriptional regulator, LacI family  44.18 
 
 
342 aa  221  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  38.99 
 
 
337 aa  219  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  42.51 
 
 
359 aa  216  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1193  transcriptional regulator, LacI family  42.73 
 
 
335 aa  207  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3075  transcriptional regulator, LacI family  41.62 
 
 
338 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6684  transcriptional regulator, LacI family  44.31 
 
 
338 aa  198  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.594008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  38.02 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20430  transcriptional regulator  42.94 
 
 
337 aa  196  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  35.93 
 
 
340 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  35.91 
 
 
348 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  37.24 
 
 
332 aa  192  7e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04030  transcriptional regulator  40.45 
 
 
351 aa  192  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 
333 aa  189  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  38.32 
 
 
334 aa  186  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  35.54 
 
 
329 aa  185  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.91 
 
 
336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  34.43 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0566  transcriptional regulator, LacI family  34.11 
 
 
328 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  35.28 
 
 
336 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0376  transcriptional regulator, LacI family  37.19 
 
 
358 aa  178  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 
336 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 
339 aa  177  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  36.97 
 
 
343 aa  176  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0881  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.74 
 
 
325 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188257  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 
341 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03798  galactose operon repressor  31.63 
 
 
333 aa  176  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  36.9 
 
 
382 aa  175  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  33.13 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  32.83 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  32.24 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0861  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.26 
 
 
292 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.19022 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  32.43 
 
 
347 aa  173  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  34.64 
 
 
334 aa  172  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  37.43 
 
 
346 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14260  transcriptional regulator  37.88 
 
 
330 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419378  normal  0.681325 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 
339 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0944  transcriptional regulator, LacI family  39.46 
 
 
334 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  32.54 
 
 
324 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  37.54 
 
 
333 aa  170  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  32.13 
 
 
386 aa  169  8e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  30.56 
 
 
338 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  35.19 
 
 
332 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  36.04 
 
 
339 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  35.12 
 
 
331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  32.24 
 
 
335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.65 
 
 
333 aa  167  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  32.65 
 
 
333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2830  transcriptional regulator, LacI family  39.94 
 
 
344 aa  165  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  35.78 
 
 
336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  28.9 
 
 
346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  35.59 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  33.11 
 
 
337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 
337 aa  163  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  34.63 
 
 
328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3330  transcriptional regulator, LacI family  35.11 
 
 
343 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  0.198785 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  35.29 
 
 
346 aa  162  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  35.48 
 
 
347 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.15 
 
 
337 aa  162  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  34.42 
 
 
343 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  34.42 
 
 
343 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  34.52 
 
 
340 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 
339 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  34.63 
 
 
340 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  34.12 
 
 
343 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  34.53 
 
 
353 aa  159  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.95 
 
 
341 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>