More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2343 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6634  transcriptional regulator, AraC family  80.89 
 
 		 405 aa  666    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.903716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2343  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 414 aa  857    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2623  AraC family transcriptional regulator  81 
 
 		 405 aa  665    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.242365 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2337  xylose operon regluatory protein  77.33 
 
 		 397 aa  629  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247833  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4185  transcriptional regulator, AraC family  76.34 
 
 		 407 aa  628  1e-179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4073  transcriptional regulator, AraC family  76.34 
 
 		 407 aa  628  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6330  AraC family transcriptional regulator  77.04 
 
 		 397 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.768767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6507  AraC family transcriptional regulator  76.07 
 
 		 397 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6741  AraC family transcriptional regulator  76.07 
 
 		 397 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.15092  normal  0.533175 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4206  AraC family transcriptional regulator  76.79 
 
 		 397 aa  617  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6031  AraC family transcriptional regulator  76.79 
 
 		 397 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6331  AraC family transcriptional regulator  76.53 
 
 		 397 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2304  AraC family transcriptional regulator  67.54 
 
 		 391 aa  535  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0753369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2882  helix-turn-helix, AraC type:periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  65.9 
 
 		 399 aa  531  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.677365  normal  0.592102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3001  xylose operon regluatory protein  66.41 
 
 		 395 aa  528  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.282498  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3724  AraC family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 390 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03421  DNA-binding transcriptional activator, xylose-binding  50.91 
 
 		 392 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.684991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0141  transcriptional regulator, AraC family  50.91 
 
 		 392 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3892  xylose operon regulatory protein  50.91 
 
 		 392 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3772  xylose operon regulatory protein  50.91 
 
 		 392 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3953  xylose operon regulatory protein  50.91 
 
 		 392 aa  398  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4945  xylose operon regulatory protein  50.91 
 
 		 392 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.462654  normal  0.028978 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03372  hypothetical protein  50.91 
 
 		 392 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716193  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4065  xylose operon regulatory protein  50.91 
 
 		 392 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0145  AraC family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 392 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0152  AraC family transcriptional regulator  50.13 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1869  helix-turn-helix domain-containing protein  49.35 
 
 		 393 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.713108 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0064  transcriptional regulator, AraC family  50.78 
 
 		 409 aa  389  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4432  transcriptional regulator, AraC family  50.52 
 
 		 392 aa  388  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0102  AraC family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0060  AraC family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4098  xylose operon regulatory protein  49.23 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4155  xylose operon regulatory protein  49.23 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.664411  normal  0.0516528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4151  transcriptional regulator, AraC family  50.26 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0082  transcriptional regulator, AraC family  49.48 
 
 		 395 aa  378  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.719713  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3985  xylose operon regulatory protein  49.48 
 
 		 392 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3876  xylose operon regulatory protein  49.48 
 
 		 392 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3940  xylose operon regulatory protein  49.48 
 
 		 392 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.688005 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3859  xylose operon regulatory protein  49.48 
 
 		 392 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4045  xylose operon regulatory protein  49.48 
 
 		 392 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.654241  normal  0.387961 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0794  AraC family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2801  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.73 
 
 		 386 aa  199  9e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.749326  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0774  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.35 
 
 		 384 aa  190  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0800  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 401 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315678 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0156  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 386 aa  163  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3765  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 385 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0713818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2316  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0587517  normal  0.0445967 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3035  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.03 
 
 		 380 aa  153  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6583  transcriptional regulator, AraC family  25.82 
 
 		 387 aa  149  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3906  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.17 
 
 		 409 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1793  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 445 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4330  transcriptional regulator, AraC family  24.87 
 
 		 386 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.547416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3229  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.48 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0197  LacI family transcription regulator  28.94 
 
 		 340 aa  68.9  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5735  transcriptional regulator AraC family  33.93 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  27.76 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  31.43 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  27.01 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  29.47 
 
 		 351 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  32.42 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0695  transcriptional regulator, LacI family  30.5 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0821691  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.17 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 331 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6428  AraC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.980502 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6085  AraC family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  30.57 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  27.56 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0128  transcriptional regulator, LacI family  29.65 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.531775 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  28.17 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  26.47 
 
 		 338 aa  63.2  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5149  transcriptional regulator, LacI family  27.89 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 1201 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  25.64 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  40 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  28.83 
 
 		 355 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  29.69 
 
 		 346 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  27.56 
 
 		 337 aa  62  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  29.35 
 
 		 338 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4153  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24804 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0274  alanine racemase  28.52 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  30.81 
 
 		 334 aa  61.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1001  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.44 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  29.82 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0508  transcriptional regulator, LacI family  30.36 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.020506 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  25.09 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3965  Alanine racemase  31.41 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.578436 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  25 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  28.97 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2799  transcriptional regulator, LacI family  30.64 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  27.14 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2245  LacI family transcription regulator  27.01 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.115687  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>