More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0120 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0120  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 351 aa  711    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4573  LacI family transcription regulator  50.87 
 
 		 350 aa  342  8e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0983  ribose operon repressor, putative  46.11 
 
 		 363 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1311  LacI family transcription regulator  44.64 
 
 		 356 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.940968 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6994  LacI family transcription regulator  45.22 
 
 		 359 aa  299  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3834  LacI family transcription regulator  44.35 
 
 		 361 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799833  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4534  LacI family transcription regulator  44.35 
 
 		 357 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.904098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5770  LacI family transcription regulator  44.35 
 
 		 361 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9131  transcriptional regulator LacI family  41.31 
 
 		 356 aa  233  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897881  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  32.15 
 
 		 331 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  34.5 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  34.78 
 
 		 332 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  31.68 
 
 		 355 aa  170  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  33.82 
 
 		 333 aa  169  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.29 
 
 		 336 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  35.26 
 
 		 329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  31.99 
 
 		 331 aa  166  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  31.49 
 
 		 335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.46 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.7 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  32.46 
 
 		 349 aa  162  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  33.73 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  32.48 
 
 		 348 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2877  transcriptional regulator, LacI family  35.49 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0226  LacI family transcription regulator  31.64 
 
 		 336 aa  159  5e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.78 
 
 		 335 aa  159  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.9 
 
 		 338 aa  159  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  36.88 
 
 		 347 aa  159  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  33.43 
 
 		 333 aa  159  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  30.52 
 
 		 323 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  31.59 
 
 		 328 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  30.52 
 
 		 323 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1790  transcription regulator protein  36.12 
 
 		 360 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.678671  normal  0.041815 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  29.79 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  32.86 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3091  LacI family transcription regulator  34.01 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  30.23 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  28.78 
 
 		 333 aa  157  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  31.36 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  28.78 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  28.78 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  28.78 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  28.78 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1481  transcriptional regulator, LacI family  30.37 
 
 		 342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  29.94 
 
 		 323 aa  155  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0975  transcriptional regulator, LacI family  34.12 
 
 		 338 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  30.9 
 
 		 332 aa  155  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  29.65 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  29.94 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  29.94 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  34.4 
 
 		 330 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2837  transcriptional regulator, LacI family  32.62 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672578  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.94 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  29.65 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29660  transcriptional regulator, LacI family  36.34 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  30.61 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  29.51 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  30.37 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  31.98 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  33.05 
 
 		 337 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1419  transcriptional regulator, LacI family  35.12 
 
 		 356 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.933801  normal  0.184887 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  32.05 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.94 
 
 		 337 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0686  LacI family transcription regulator  31.52 
 
 		 334 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  31.32 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  29.36 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  32.3 
 
 		 337 aa  152  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1460  transcriptional regulator, LacI family  35.12 
 
 		 356 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0141269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4573  LacI family transcription regulator  32.46 
 
 		 326 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0936264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  31.32 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  32.69 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  31.43 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4696  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.73 
 
 		 339 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  31.14 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0506  LacI family transcription regulator  30.57 
 
 		 332 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.549777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  30.85 
 
 		 347 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  32.56 
 
 		 337 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  31.14 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  31.86 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0201  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 342 aa  149  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0642992 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4219  transcriptional repressor RbsR  31.03 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817954  normal  0.878921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  33.05 
 
 		 337 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.93 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  31.2 
 
 		 335 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  31.43 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  30.77 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2717  LacI family transcription regulator  33.62 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  31.43 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  27.91 
 
 		 334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  31.1 
 
 		 339 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  32.39 
 
 		 338 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4069  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 367 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  33.72 
 
 		 337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5165  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 330 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3452  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 369 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  29.77 
 
 		 333 aa  146  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0892  transcriptional regulator, LacI family  32.77 
 
 		 348 aa  145  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.774645  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  28.94 
 
 		 333 aa  145  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>