More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene pE33L466_0296 on replicon NC_007103
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  100 
 
 
331 aa  668    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  65.55 
 
 
332 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  42.99 
 
 
333 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  42.99 
 
 
333 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  42.99 
 
 
333 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  42.99 
 
 
333 aa  290  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  42.99 
 
 
333 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  42.07 
 
 
334 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  39.46 
 
 
335 aa  255  9e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.06 
 
 
336 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.84 
 
 
330 aa  249  5e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  39.16 
 
 
353 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  38.6 
 
 
337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  39.94 
 
 
339 aa  242  7e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  38.67 
 
 
338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.67 
 
 
337 aa  239  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  38.51 
 
 
346 aa  238  9e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  37.99 
 
 
348 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  38.51 
 
 
346 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  41.67 
 
 
342 aa  236  3e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.41 
 
 
339 aa  235  6e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  37.99 
 
 
340 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  37.39 
 
 
337 aa  235  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  41.39 
 
 
332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  37.69 
 
 
340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  37.39 
 
 
340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  36.7 
 
 
332 aa  232  6e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  37.61 
 
 
347 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  37.08 
 
 
340 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  35.33 
 
 
340 aa  229  5e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  37.46 
 
 
338 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  36.64 
 
 
346 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  37.88 
 
 
343 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  38.97 
 
 
357 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.78 
 
 
333 aa  225  9e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  35.78 
 
 
333 aa  225  9e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  37.13 
 
 
337 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  36.34 
 
 
346 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0226  LacI family transcription regulator  37.69 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  34.43 
 
 
339 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  36.56 
 
 
343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  36.86 
 
 
343 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  38.19 
 
 
333 aa  219  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  36.86 
 
 
343 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  36.25 
 
 
332 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  36.25 
 
 
332 aa  219  7e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  36.56 
 
 
332 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  36.25 
 
 
332 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  38.11 
 
 
331 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2503  transcriptional regulator  34.73 
 
 
339 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117668  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  36.25 
 
 
332 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  36.06 
 
 
339 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  36.56 
 
 
343 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  35.95 
 
 
332 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  36.56 
 
 
343 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  36.56 
 
 
343 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  36.56 
 
 
343 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  36.25 
 
 
332 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  35.95 
 
 
332 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  35.95 
 
 
332 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  36.34 
 
 
333 aa  216  5e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  37.31 
 
 
328 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  36.47 
 
 
343 aa  215  8e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  35.95 
 
 
332 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  35.65 
 
 
332 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  35.35 
 
 
353 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  36.14 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1683  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.85 
 
 
341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  37.91 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  36.47 
 
 
343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  36.47 
 
 
343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  36.47 
 
 
343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  32.52 
 
 
334 aa  212  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  36.06 
 
 
334 aa  212  5.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  34.64 
 
 
349 aa  212  7.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.94 
 
 
341 aa  212  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.94 
 
 
341 aa  212  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.94 
 
 
341 aa  212  9e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  38.07 
 
 
339 aa  211  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  34.03 
 
 
333 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.24 
 
 
341 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.94 
 
 
341 aa  210  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  36.94 
 
 
338 aa  209  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000864233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  35.35 
 
 
330 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  36.28 
 
 
329 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1870  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.53 
 
 
337 aa  209  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.796705  normal  0.714887 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  36.14 
 
 
342 aa  209  7e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.33 
 
 
341 aa  209  8e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  33.84 
 
 
326 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.94 
 
 
341 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.76 
 
 
338 aa  208  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20530  transcriptional regulator, LacI family  35.63 
 
 
341 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  39.16 
 
 
324 aa  207  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  33.13 
 
 
334 aa  206  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.55 
 
 
331 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.06 
 
 
335 aa  206  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  34.44 
 
 
338 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  35.5 
 
 
336 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  33.97 
 
 
337 aa  204  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 
358 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>