More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0040 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 330 aa  660    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4247  alanine racemase  44.14 
 
 		 349 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.645123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.09 
 
 		 352 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  41.16 
 
 		 349 aa  237  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  40.48 
 
 		 342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  40.73 
 
 		 342 aa  225  9e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  38.67 
 
 		 332 aa  221  9e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.56 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  40.06 
 
 		 346 aa  219  6e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 346 aa  215  8e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.27 
 
 		 335 aa  215  9e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  38.86 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  35.67 
 
 		 335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  37.24 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.55 
 
 		 337 aa  209  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5754  transcriptional regulator, LacI family  39.51 
 
 		 348 aa  208  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.597528  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  38.11 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5553  transcriptional regulator LacI family  36.44 
 
 		 356 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  38.37 
 
 		 329 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  37.98 
 
 		 347 aa  206  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3620  transcriptional regulator, LacI family  35.45 
 
 		 342 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  36.34 
 
 		 368 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  36.8 
 
 		 353 aa  206  6e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0226  LacI family transcription regulator  34.33 
 
 		 336 aa  205  7e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3383  LacI family transcription regulator  38.3 
 
 		 342 aa  205  9e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38350  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 343 aa  205  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  39.43 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  37.35 
 
 		 337 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.54 
 
 		 356 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  33.13 
 
 		 333 aa  202  6e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  36.62 
 
 		 333 aa  202  7e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  39.02 
 
 		 334 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  36.78 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  36.94 
 
 		 335 aa  200  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  36.17 
 
 		 337 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  36.5 
 
 		 346 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  36.5 
 
 		 346 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  37.25 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  35.87 
 
 		 353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  37.25 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  34.73 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  33.63 
 
 		 333 aa  197  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 		 343 aa  195  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  34.23 
 
 		 338 aa  196  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  35.05 
 
 		 330 aa  195  7e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  37.25 
 
 		 340 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.34 
 
 		 333 aa  195  8.000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  34.04 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3131  transcriptional regulator, LacI family  36.34 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  hitchhiker  0.005841 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  35.45 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.04 
 
 		 341 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  33.73 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.04 
 
 		 341 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.04 
 
 		 341 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  33.73 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.73 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0058  LacI family transcription regulator  36.36 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1005  transcriptional regulator, LacI family  34.44 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  33.73 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0299  transcriptional regulator protein  36.89 
 
 		 365 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.63 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0187  transcriptional regulator, LacI family  39.22 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  33.43 
 
 		 332 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  36.47 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5940  transcriptional regulator, LacI family  37.3 
 
 		 347 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146898  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  34.83 
 
 		 346 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  33.43 
 
 		 332 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  33.43 
 
 		 332 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  37.05 
 
 		 347 aa  192  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  33.74 
 
 		 332 aa  192  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  33.43 
 
 		 332 aa  192  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  33.43 
 
 		 332 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  34.23 
 
 		 334 aa  192  7e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  33.63 
 
 		 334 aa  192  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.44 
 
 		 339 aa  192  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  32.83 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4620  transcriptional regulator, LacI family  39.57 
 
 		 349 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  35.87 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  35.87 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  35.87 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  35.87 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  37.09 
 
 		 353 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  32.94 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  36.2 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  35.87 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  35.33 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.89 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.63 
 
 		 330 aa  189  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  35.37 
 
 		 326 aa  190  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  35.87 
 
 		 338 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  35.44 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.24 
 
 		 341 aa  189  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  35.03 
 
 		 336 aa  189  7e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  35.83 
 
 		 343 aa  189  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.62 
 
 		 331 aa  188  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  35.35 
 
 		 343 aa  188  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  34.23 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0710  transcriptional regulator, LacI family  36.86 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0832389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  34.52 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  34.64 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>