More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6090 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 347 aa  682    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7934  putative LacI-family transcriptional regulator  59.88 
 
 		 335 aa  355  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2567  transcriptional regulator, LacI family  55.75 
 
 		 342 aa  330  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.789697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4620  transcriptional regulator, LacI family  48.25 
 
 		 349 aa  295  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5754  transcriptional regulator, LacI family  50.6 
 
 		 348 aa  276  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.597528  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5940  transcriptional regulator, LacI family  48.32 
 
 		 347 aa  276  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146898  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3400  transcriptional regulator, LacI family  50.46 
 
 		 338 aa  273  5.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.125574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2664  transcriptional regulator, LacI family  45.53 
 
 		 352 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3489  LacI family transcription regulator  47.38 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0487492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3259  alanine racemase  47.69 
 
 		 338 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.884845  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1432  transcriptional regulator, LacI family  46.6 
 
 		 324 aa  265  7e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.629194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1691  transcriptional regulator, LacI family  46.13 
 
 		 341 aa  263  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0314799  normal  0.084893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  47.58 
 
 		 349 aa  250  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  43.75 
 
 		 346 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2268  transcriptional regulator, LacI family  41.62 
 
 		 338 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5028  transcriptional regulator, LacI family  43.11 
 
 		 348 aa  232  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108824  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0995  transcriptional regulator, LacI family  48.2 
 
 		 349 aa  227  3e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2013  transcriptional regulator, LacI family  43.53 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3975  transcriptional regulator, LacI family  41.46 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00653549  normal  0.0330479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3595  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.03 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.199823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3961  transcriptional regulator, LacI family  39.26 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0946705 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  41.77 
 
 		 348 aa  199  7.999999999999999e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.89 
 
 		 352 aa  196  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  37.05 
 
 		 330 aa  192  6e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  34.33 
 
 		 342 aa  192  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  37.2 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  39.76 
 
 		 353 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4767  transcriptional regulator, LacI family  40.55 
 
 		 330 aa  186  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  34.15 
 
 		 347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  38.96 
 
 		 326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3131  transcriptional regulator, LacI family  38.41 
 
 		 334 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  hitchhiker  0.005841 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3964  transcriptional regulator, LacI family  40.95 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147565  normal  0.0529978 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 346 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  37.65 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.96 
 
 		 356 aa  173  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.06 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.33 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  35.94 
 
 		 354 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3620  transcriptional regulator, LacI family  35.56 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  35.98 
 
 		 331 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  34.02 
 
 		 358 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3559  transcriptional regulator, LacI family  40.06 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.156963  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  34.81 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38350  transcriptional regulator  37.05 
 
 		 343 aa  163  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3984  transcriptional regulator, LacI family  36.71 
 
 		 336 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.2 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0187  transcriptional regulator, LacI family  38.79 
 
 		 339 aa  162  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  34.91 
 
 		 381 aa  162  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  29.04 
 
 		 341 aa  162  7e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.4 
 
 		 339 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  34.15 
 
 		 332 aa  162  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  35.42 
 
 		 353 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  34.14 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  37.58 
 
 		 334 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4388  LacI family transcription regulator  38.44 
 
 		 329 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4475  LacI family transcription regulator  38.44 
 
 		 329 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4769  LacI family transcription regulator  38.44 
 
 		 329 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  33.13 
 
 		 357 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0014  transcriptional regulator, LacI family  37.39 
 
 		 344 aa  159  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1005  transcriptional regulator, LacI family  29.7 
 
 		 336 aa  159  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  32.16 
 
 		 337 aa  159  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  30.36 
 
 		 344 aa  158  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  35.26 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0710  transcriptional regulator, LacI family  34.85 
 
 		 334 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0832389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1984  LacI family transcription regulator  33.9 
 
 		 360 aa  157  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1973  LacI family transcription regulator  36.06 
 
 		 341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.768247  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.39 
 
 		 336 aa  155  8e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  33.93 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  31.12 
 
 		 343 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  37.31 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4672  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.92 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1971  LacI family transcription regulator  34.65 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137395  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  33.23 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  36.05 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  35.69 
 
 		 359 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0299  transcriptional regulator protein  33.14 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  34.09 
 
 		 343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.6 
 
 		 338 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  32.84 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2074  transcriptional regulator, LacI family  32.49 
 
 		 338 aa  153  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  30.09 
 
 		 335 aa  153  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  31.93 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  35.69 
 
 		 323 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  31.07 
 
 		 368 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  31.1 
 
 		 323 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  31.1 
 
 		 323 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  31.1 
 
 		 323 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 342 aa  152  8.999999999999999e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1599  LacI family transcription regulator  27.6 
 
 		 346 aa  151  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  33.53 
 
 		 331 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  34.82 
 
 		 333 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  31.1 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  34.44 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3761  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.08 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.193562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  31.1 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  34.76 
 
 		 335 aa  152  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.83 
 
 		 347 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3367  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.47 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00871192 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  30.79 
 
 		 323 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  31.49 
 
 		 355 aa  150  4e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>