More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4283 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  100 
 
 
341 aa  703    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1618  DNA-binding transcriptional repressor MalI  40.54 
 
 
340 aa  273  3e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.671811  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  41.77 
 
 
358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2271  DNA-binding transcriptional repressor MalI  42.06 
 
 
352 aa  253  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.485606  normal  0.0115429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  40.43 
 
 
357 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0272  LacI family transcription regulator  37.94 
 
 
365 aa  243  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.419733  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0624  LacI family transcription regulator  40.3 
 
 
348 aa  241  9e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.393739  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.52 
 
 
347 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  38.07 
 
 
352 aa  236  4e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3336  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.36 
 
 
341 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0752084  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1971  LacI family transcription regulator  37.46 
 
 
352 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137395  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1374  transcriptional regulator, LacI family  37.35 
 
 
357 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748872  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0870  alanine racemase  37.05 
 
 
351 aa  229  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1478  transcriptional regulator, LacI family  37.05 
 
 
348 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764656  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3568  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.11 
 
 
339 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2652  LacI family transcription regulator  35.26 
 
 
335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126307  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2376  transcriptional regulator, LacI family  36.47 
 
 
352 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1775  transcriptional regulator, LacI family  36.47 
 
 
350 aa  223  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.443552 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3381  transcriptional regulator, LacI family  35.26 
 
 
340 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.289071 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3679  transcriptional regulator, LacI family  35.26 
 
 
340 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.196909 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2846  LacI family transcription regulator  35.53 
 
 
326 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1376  alanine racemase  33.74 
 
 
339 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  35.37 
 
 
347 aa  214  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3792  transcriptional regulator LacI family  34.85 
 
 
341 aa  214  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190437  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2764  alanine racemase  33.94 
 
 
340 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923309  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0926  putative transcriptional regulator  33.74 
 
 
339 aa  212  9e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.133438  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0984  transcriptional regulator, putative  33.43 
 
 
339 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.879842  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3749  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.24 
 
 
344 aa  209  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  35.14 
 
 
342 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674851 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  36.89 
 
 
337 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2332  DNA-binding transcriptional repressor MalI  34.83 
 
 
342 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  35.24 
 
 
368 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1808  DNA-binding transcriptional repressor MalI  34.83 
 
 
342 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1828  DNA-binding transcriptional repressor MalI  34.83 
 
 
342 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1579  DNA-binding transcriptional repressor MalI  34.83 
 
 
342 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2022  transcriptional regulator, LacI family  34.83 
 
 
342 aa  203  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1695  DNA-binding transcriptional repressor MalI  34.83 
 
 
342 aa  203  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01228  transcriptional regulator  36.04 
 
 
354 aa  203  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00348706  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2010  DNA-binding transcriptional repressor MalI  34.83 
 
 
342 aa  203  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.708853 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01589  DNA-binding transcriptional repressor  34.83 
 
 
342 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.784776  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01579  hypothetical protein  34.83 
 
 
342 aa  202  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  36.28 
 
 
338 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.76 
 
 
333 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  34.76 
 
 
333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  37.2 
 
 
337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3383  LacI family transcription regulator  36.49 
 
 
344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0237122 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1564  DNA-binding transcriptional repressor MalI  33.93 
 
 
342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.253156 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5078  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.45 
 
 
337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0397942  normal  0.741474 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0983  LacI family transcription regulator  34.51 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.770918  normal  0.446903 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 
335 aa  196  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.7 
 
 
336 aa  195  9e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0565  LacI family transcription regulator  34.65 
 
 
339 aa  193  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  33.74 
 
 
337 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  31.42 
 
 
331 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  32.33 
 
 
341 aa  191  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 
342 aa  189  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  37.8 
 
 
346 aa  189  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  34.55 
 
 
358 aa  188  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  35.15 
 
 
340 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0074  LacI family transcription regulator  31.63 
 
 
351 aa  188  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.840414  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  35.82 
 
 
349 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  35.74 
 
 
340 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  35.52 
 
 
342 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  33.33 
 
 
338 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  34.83 
 
 
340 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  35.14 
 
 
340 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1177  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.93 
 
 
360 aa  186  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 
332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  33.94 
 
 
339 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1853  LacI family transcription regulator  34.72 
 
 
340 aa  184  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0619869  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  31.67 
 
 
347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  31.42 
 
 
332 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  32.73 
 
 
334 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  35.05 
 
 
353 aa  180  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  34.53 
 
 
346 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.45 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3927  LacI family transcription regulator  33.13 
 
 
334 aa  180  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  29.05 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  31.55 
 
 
341 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  32.24 
 
 
341 aa  179  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 
346 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  31.04 
 
 
337 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0892  LacI family transcription regulator  33.93 
 
 
346 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00803151  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.13 
 
 
338 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1861  transcriptional regulator  33.73 
 
 
340 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.453605  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  34.55 
 
 
333 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.43 
 
 
335 aa  177  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  32.85 
 
 
346 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  31.31 
 
 
330 aa  176  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  30.79 
 
 
352 aa  176  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  31.94 
 
 
347 aa  176  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  32.25 
 
 
342 aa  175  9e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.52 
 
 
330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  31.93 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  32.43 
 
 
346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  32.54 
 
 
333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  31.5 
 
 
331 aa  173  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  32.52 
 
 
343 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6195  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.32 
 
 
337 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193526  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  32.53 
 
 
354 aa  172  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.371514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>