More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0995 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0995  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 349 aa  682    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5754  transcriptional regulator, LacI family  51.2 
 
 		 348 aa  296  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.597528  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3400  transcriptional regulator, LacI family  50.91 
 
 		 338 aa  295  1e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.125574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  48.2 
 
 		 347 aa  262  6.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1691  transcriptional regulator, LacI family  45.51 
 
 		 341 aa  259  7e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0314799  normal  0.084893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5940  transcriptional regulator, LacI family  44.74 
 
 		 347 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146898  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2664  transcriptional regulator, LacI family  42.24 
 
 		 352 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7934  putative LacI-family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 335 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  43.11 
 
 		 349 aa  233  3e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2567  transcriptional regulator, LacI family  43.44 
 
 		 342 aa  229  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.789697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4620  transcriptional regulator, LacI family  40.48 
 
 		 349 aa  228  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1432  transcriptional regulator, LacI family  43.16 
 
 		 324 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.629194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5028  transcriptional regulator, LacI family  40.3 
 
 		 348 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108824  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  41.03 
 
 		 346 aa  203  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  39.94 
 
 		 353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3975  transcriptional regulator, LacI family  39.94 
 
 		 329 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00653549  normal  0.0330479 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2013  transcriptional regulator, LacI family  41.72 
 
 		 341 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  39.64 
 
 		 354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4767  transcriptional regulator, LacI family  39.88 
 
 		 330 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3259  alanine racemase  38.14 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.884845  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3489  LacI family transcription regulator  37.65 
 
 		 338 aa  193  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0487492 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.94 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3961  transcriptional regulator, LacI family  39.02 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0946705 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3964  transcriptional regulator, LacI family  40.36 
 
 		 332 aa  186  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147565  normal  0.0529978 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  36 
 
 		 347 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 336 aa  182  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.13 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  35.95 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  35.84 
 
 		 334 aa  179  5.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  36.47 
 
 		 335 aa  179  7e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  36.78 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  36.39 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  36.78 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  38.23 
 
 		 331 aa  176  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  38.82 
 
 		 337 aa  175  9e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  29 
 
 		 341 aa  173  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  32.37 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  35.96 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  35.03 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  36.33 
 
 		 347 aa  169  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1973  LacI family transcription regulator  38.82 
 
 		 341 aa  169  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.768247  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3984  transcriptional regulator, LacI family  36.98 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3595  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.26 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.199823 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.42 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3131  transcriptional regulator, LacI family  39.88 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  hitchhiker  0.005841 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  32.57 
 
 		 368 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  36.08 
 
 		 340 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0426  transcriptional regulator, LacI family  36.94 
 
 		 381 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1775  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.443552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  35.22 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  32.13 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  32.52 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  35.56 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  30.82 
 
 		 342 aa  164  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.03 
 
 		 352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  34.83 
 
 		 353 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1005  transcriptional regulator, LacI family  31.01 
 
 		 336 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  30.82 
 
 		 344 aa  161  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4950  putative LacI family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213435  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.93 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  32.48 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  35.44 
 
 		 340 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  29.79 
 
 		 347 aa  160  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  30.84 
 
 		 339 aa  160  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.86 
 
 		 356 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05790  transcriptional regulator  35.89 
 
 		 347 aa  159  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2268  transcriptional regulator, LacI family  35.89 
 
 		 338 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0880  transcriptional regulator, LacI family  37.69 
 
 		 338 aa  159  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 353 aa  159  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.53 
 
 		 347 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.31 
 
 		 330 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  35.52 
 
 		 342 aa  159  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3620  transcriptional regulator, LacI family  35.12 
 
 		 342 aa  159  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  32.73 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  33.53 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  30.95 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2503  transcriptional regulator  30.24 
 
 		 339 aa  158  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117668  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6552  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  34.18 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  hitchhiker  0.0000198251 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1374  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 		 357 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748872  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  34.02 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  35.13 
 
 		 340 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  36.2 
 
 		 333 aa  156  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  35.21 
 
 		 348 aa  157  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 343 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  32.05 
 
 		 352 aa  155  8e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  34.81 
 
 		 337 aa  155  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  32.63 
 
 		 332 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1478  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 348 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764656  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  32.43 
 
 		 335 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  35.13 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  34.08 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  33.92 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0299  transcriptional regulator protein  36.42 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 357 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0416  LacI family transcription regulator  32.37 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.339437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00486  transcriptional regulator LacI family  35.37 
 
 		 331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  35.24 
 
 		 359 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  33.76 
 
 		 346 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5418  transcriptional regulator, LacI family  34 
 
 		 356 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>