More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2567 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2567  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 342 aa  664    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.789697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  55.75 
 
 		 347 aa  330  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7934  putative LacI-family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 335 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4620  transcriptional regulator, LacI family  49.71 
 
 		 349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5754  transcriptional regulator, LacI family  48.09 
 
 		 348 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.597528  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3259  alanine racemase  46.87 
 
 		 338 aa  256  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.884845  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1691  transcriptional regulator, LacI family  46.96 
 
 		 341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0314799  normal  0.084893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2664  transcriptional regulator, LacI family  43.45 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3400  transcriptional regulator, LacI family  47.23 
 
 		 338 aa  250  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.125574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5940  transcriptional regulator, LacI family  46.76 
 
 		 347 aa  249  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146898  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3489  LacI family transcription regulator  45.07 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0487492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1432  transcriptional regulator, LacI family  45.16 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.629194 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  43.36 
 
 		 346 aa  224  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5028  transcriptional regulator, LacI family  40.64 
 
 		 348 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108824  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  43.9 
 
 		 349 aa  219  7e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3975  transcriptional regulator, LacI family  41.28 
 
 		 329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00653549  normal  0.0330479 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0995  transcriptional regulator, LacI family  43.15 
 
 		 349 aa  199  6e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2268  transcriptional regulator, LacI family  38.62 
 
 		 338 aa  199  7.999999999999999e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2013  transcriptional regulator, LacI family  41.45 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3595  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.11 
 
 		 356 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.199823 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3961  transcriptional regulator, LacI family  39.36 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0946705 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  38.58 
 
 		 354 aa  188  9e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3964  transcriptional regulator, LacI family  40.87 
 
 		 332 aa  188  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147565  normal  0.0529978 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  38.58 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  35.19 
 
 		 342 aa  186  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  34.23 
 
 		 347 aa  185  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  37.91 
 
 		 336 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  39.58 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  36.05 
 
 		 342 aa  182  7e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.73 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  35.99 
 
 		 333 aa  179  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  37.13 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  37.39 
 
 		 334 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  36.39 
 
 		 330 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.14 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4767  transcriptional regulator, LacI family  37.54 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  37.54 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.26 
 
 		 356 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  38.08 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3984  transcriptional regulator, LacI family  38.72 
 
 		 336 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0187  transcriptional regulator, LacI family  37.14 
 
 		 339 aa  165  8e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  31.44 
 
 		 341 aa  166  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  35.33 
 
 		 358 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6552  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  37.5 
 
 		 376 aa  162  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  hitchhiker  0.0000198251 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  34.6 
 
 		 334 aa  162  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  35.5 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  29.08 
 
 		 341 aa  161  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0134  transcriptional regulator, LacI family  37.25 
 
 		 360 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  34.03 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  37.54 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0299  transcriptional regulator protein  34.62 
 
 		 365 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30 
 
 		 336 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  33.71 
 
 		 346 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  34.02 
 
 		 368 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  34 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0710  transcriptional regulator, LacI family  35.38 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0832389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  35.99 
 
 		 359 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  38.05 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3131  transcriptional regulator, LacI family  35.36 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  hitchhiker  0.005841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  38.11 
 
 		 347 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0802  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.71 
 
 		 333 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3559  transcriptional regulator, LacI family  37.06 
 
 		 339 aa  156  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.156963  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  30.56 
 
 		 335 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  33.43 
 
 		 368 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  33.53 
 
 		 337 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  35.91 
 
 		 354 aa  156  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3040  transcriptional regulator, LacI family  37.72 
 
 		 339 aa  156  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4388  LacI family transcription regulator  39.07 
 
 		 329 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4475  LacI family transcription regulator  39.07 
 
 		 329 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4769  LacI family transcription regulator  39.07 
 
 		 329 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 348 aa  155  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  32.26 
 
 		 338 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  33.33 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  31.85 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  33.14 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1005  transcriptional regulator, LacI family  28.4 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 343 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 343 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  29.46 
 
 		 333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 343 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 343 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 343 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  31.1 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 343 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.42 
 
 		 335 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  35.73 
 
 		 336 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  33.92 
 
 		 346 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38350  transcriptional regulator  34.71 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3676  LacI family transcription regulator  35.4 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  34.22 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  34.51 
 
 		 340 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  34.8 
 
 		 339 aa  149  7e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.64 
 
 		 339 aa  149  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  31.7 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.76 
 
 		 337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  28.49 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  29.5 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>