More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7027 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 353 aa  712    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3620  transcriptional regulator, LacI family  53.67 
 
 		 342 aa  351  1e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3131  transcriptional regulator, LacI family  53.29 
 
 		 334 aa  338  5.9999999999999996e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  hitchhiker  0.005841 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  48.66 
 
 		 335 aa  318  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3367  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  49.25 
 
 		 330 aa  304  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00871192 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  45.45 
 
 		 332 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3559  transcriptional regulator, LacI family  49.1 
 
 		 339 aa  293  4e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.156963  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38350  transcriptional regulator  48.33 
 
 		 343 aa  288  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0710  transcriptional regulator, LacI family  45.92 
 
 		 334 aa  275  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0832389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6931  transcriptional regulator, LacI family  46.5 
 
 		 315 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  44.21 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  39.63 
 
 		 342 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  39.64 
 
 		 342 aa  238  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.99 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.06 
 
 		 338 aa  229  8e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  40.24 
 
 		 333 aa  225  8e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  41.02 
 
 		 349 aa  217  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  37.43 
 
 		 348 aa  216  5.9999999999999996e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  39.29 
 
 		 346 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  39.07 
 
 		 346 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0058  LacI family transcription regulator  40.12 
 
 		 338 aa  216  7e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  38.87 
 
 		 347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  40.66 
 
 		 346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 346 aa  212  7e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  36.29 
 
 		 347 aa  212  9e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  38.97 
 
 		 337 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  38.3 
 
 		 353 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  37.76 
 
 		 334 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1005  transcriptional regulator, LacI family  34.04 
 
 		 336 aa  209  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.83 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.94 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  39.63 
 
 		 348 aa  203  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0187  transcriptional regulator, LacI family  40.72 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  38.18 
 
 		 338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  38.46 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  38.37 
 
 		 357 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  35.14 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  35.52 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7016  LacI family transcription regulator  97.14 
 
 		 108 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  35.87 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  36.17 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  39.39 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  31.61 
 
 		 333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  37.58 
 
 		 332 aa  196  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  38.64 
 
 		 337 aa  196  7e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  34.82 
 
 		 338 aa  196  8.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  32.83 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  39.4 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4620  transcriptional regulator, LacI family  37.84 
 
 		 349 aa  193  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  36.67 
 
 		 337 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  33.33 
 
 		 333 aa  192  5e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  34.35 
 
 		 331 aa  192  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  35.95 
 
 		 368 aa  192  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2503  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 339 aa  192  7e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117668  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  31.91 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  32.83 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  35.71 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  33.44 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  36.97 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.23 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  35.71 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  35.47 
 
 		 358 aa  190  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5347  transcriptional regulator, LacI family  35.74 
 
 		 335 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.993623  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  34.56 
 
 		 333 aa  189  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  31.31 
 
 		 336 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  34.44 
 
 		 330 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.74 
 
 		 332 aa  189  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  36.01 
 
 		 340 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  34.7 
 
 		 355 aa  189  9e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  39.12 
 
 		 337 aa  188  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  35.5 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  35.14 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  35.14 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  35.14 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  36.53 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0226  LacI family transcription regulator  31.45 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  35.05 
 
 		 343 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  35.05 
 
 		 343 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.52 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  34.83 
 
 		 330 aa  187  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  35.05 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  35.05 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  36.53 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  35.05 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  33.54 
 
 		 337 aa  187  3e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  35.05 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  35.14 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  32.74 
 
 		 332 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  33.33 
 
 		 368 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  37.46 
 
 		 333 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  39.76 
 
 		 347 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  34.74 
 
 		 343 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  37.39 
 
 		 331 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4247  alanine racemase  37.35 
 
 		 349 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.645123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  34.45 
 
 		 357 aa  186  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  32.66 
 
 		 341 aa  186  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  32.15 
 
 		 336 aa  185  9e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  31 
 
 		 341 aa  185  9e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.03 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.03 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>