More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3559 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3559  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 339 aa  671    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.156963  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  49.1 
 
 		 353 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3367  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  50.9 
 
 		 330 aa  289  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00871192 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.54 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3620  transcriptional regulator, LacI family  42.94 
 
 		 342 aa  263  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3131  transcriptional regulator, LacI family  43.67 
 
 		 334 aa  255  8e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  hitchhiker  0.005841 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  41.69 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0710  transcriptional regulator, LacI family  42.47 
 
 		 334 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0832389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38350  transcriptional regulator  43.81 
 
 		 343 aa  236  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6931  transcriptional regulator, LacI family  43.64 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  36.72 
 
 		 347 aa  206  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  35.15 
 
 		 342 aa  206  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.31 
 
 		 352 aa  202  7e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  37.01 
 
 		 334 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0058  LacI family transcription regulator  37.46 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  33.93 
 
 		 330 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  37.69 
 
 		 346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  34.93 
 
 		 337 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  35.99 
 
 		 337 aa  180  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  32.29 
 
 		 333 aa  179  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  35.4 
 
 		 333 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  35.74 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  36.42 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  36.42 
 
 		 343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  36.42 
 
 		 343 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  34.78 
 
 		 334 aa  173  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  31.83 
 
 		 335 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  36.1 
 
 		 343 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  36.53 
 
 		 349 aa  172  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.61 
 
 		 356 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  36.1 
 
 		 343 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  36.1 
 
 		 343 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  32.73 
 
 		 337 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  36.31 
 
 		 343 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  36.1 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  36.1 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  36.1 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  36.1 
 
 		 343 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5754  transcriptional regulator, LacI family  36.17 
 
 		 348 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.597528  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5347  transcriptional regulator, LacI family  35.28 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.993623  normal  0.389225 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  34.38 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  35.78 
 
 		 343 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  34.12 
 
 		 332 aa  170  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1104  periplasmic sugar binding transcriptional regulator  34.63 
 
 		 343 aa  169  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  31.01 
 
 		 336 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  36.42 
 
 		 346 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  33.13 
 
 		 333 aa  169  7e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  32.91 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  32.73 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  35.78 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  33.87 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  35.74 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4042  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.06 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5883  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.64 
 
 		 356 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.92391 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  33.55 
 
 		 346 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3984  transcriptional regulator, LacI family  37.08 
 
 		 336 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  40.06 
 
 		 347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  37.72 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 346 aa  163  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.95 
 
 		 338 aa  162  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4466  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 		 333 aa  162  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  34.95 
 
 		 343 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2056  LacI family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 344 aa  162  9e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.727085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  34.23 
 
 		 339 aa  162  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  32.42 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  31.13 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.71 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  30.13 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  31.91 
 
 		 358 aa  160  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 339 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5553  transcriptional regulator LacI family  32.65 
 
 		 356 aa  159  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539573  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1005  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 		 336 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7934  putative LacI-family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4620  transcriptional regulator, LacI family  35.45 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  31.52 
 
 		 357 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  30.46 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  32.48 
 
 		 334 aa  158  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  30.94 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  33.54 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  33.54 
 
 		 330 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2567  transcriptional regulator, LacI family  37.06 
 
 		 342 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.789697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  35.67 
 
 		 338 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6389  transcriptional regulator, LacI family  34.42 
 
 		 342 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  28.39 
 
 		 336 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  33.54 
 
 		 330 aa  156  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  32.5 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  30.12 
 
 		 336 aa  156  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  35.76 
 
 		 331 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  33.23 
 
 		 330 aa  155  7e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  33.23 
 
 		 330 aa  155  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2877  transcriptional regulator, LacI family  35.22 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0137169 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00486  transcriptional regulator LacI family  36.56 
 
 		 331 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 337 aa  154  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  33.97 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  31.74 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4247  alanine racemase  32.62 
 
 		 349 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.645123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  34.18 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.14 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.14 
 
 		 341 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>