More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4620 on replicon NC_011881
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011881  Achl_4620  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 349 aa  696    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7934  putative LacI-family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 335 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2567  transcriptional regulator, LacI family  49.71 
 
 		 342 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.789697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  48.25 
 
 		 347 aa  296  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5754  transcriptional regulator, LacI family  45.99 
 
 		 348 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.597528  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5940  transcriptional regulator, LacI family  45.73 
 
 		 347 aa  266  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146898  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1691  transcriptional regulator, LacI family  43.28 
 
 		 341 aa  256  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0314799  normal  0.084893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2664  transcriptional regulator, LacI family  41.09 
 
 		 352 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  43.11 
 
 		 349 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  43.43 
 
 		 346 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3489  LacI family transcription regulator  43.12 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0487492 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3400  transcriptional regulator, LacI family  41.87 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.125574 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3259  alanine racemase  42.81 
 
 		 338 aa  225  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.884845  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5028  transcriptional regulator, LacI family  42.3 
 
 		 348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108824  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3975  transcriptional regulator, LacI family  39.63 
 
 		 329 aa  220  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00653549  normal  0.0330479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3595  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.09 
 
 		 356 aa  217  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.199823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1432  transcriptional regulator, LacI family  41.05 
 
 		 324 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.629194 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  36.04 
 
 		 342 aa  202  9e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2268  transcriptional regulator, LacI family  36.92 
 
 		 338 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0995  transcriptional regulator, LacI family  39.88 
 
 		 349 aa  199  6e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2013  transcriptional regulator, LacI family  38.76 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3964  transcriptional regulator, LacI family  39.14 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147565  normal  0.0529978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  37.84 
 
 		 353 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  36.09 
 
 		 333 aa  194  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  39.57 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  35.33 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.44 
 
 		 338 aa  186  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  38.21 
 
 		 342 aa  185  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 336 aa  182  9.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.64 
 
 		 352 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  34.97 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  36.39 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3961  transcriptional regulator, LacI family  36.53 
 
 		 334 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0946705 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  36.09 
 
 		 354 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.14 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  36.81 
 
 		 348 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4767  transcriptional regulator, LacI family  36.28 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 340 aa  176  6e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.32 
 
 		 356 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1005  transcriptional regulator, LacI family  32.73 
 
 		 336 aa  173  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  34.64 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.64 
 
 		 335 aa  169  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  31.34 
 
 		 338 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3542  transcriptional regulator, LacI family  30.46 
 
 		 335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  34.46 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.94 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  32.63 
 
 		 357 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  30.89 
 
 		 335 aa  166  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1482  transcriptional regulator, LacI family  31.23 
 
 		 337 aa  165  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  33.03 
 
 		 358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  35.37 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  34.25 
 
 		 334 aa  164  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  29.36 
 
 		 333 aa  162  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3559  transcriptional regulator, LacI family  35.45 
 
 		 339 aa  162  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.156963  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  31.12 
 
 		 341 aa  162  9e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4008  transcriptional regulator, LacI family  30.56 
 
 		 340 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000985107  hitchhiker  0.00000124933 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.21 
 
 		 339 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0777  LacI transcriptional regulator  33.13 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 		 337 aa  161  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0058  LacI family transcription regulator  35.87 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  33.54 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  31.56 
 
 		 368 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  36.25 
 
 		 352 aa  158  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  29.94 
 
 		 344 aa  156  6e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  37.08 
 
 		 347 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.75 
 
 		 333 aa  155  8e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1971  LacI family transcription regulator  35.95 
 
 		 352 aa  155  8e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  32.12 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0299  transcriptional regulator protein  31.44 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2503  transcriptional regulator  30.27 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117668  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  31.91 
 
 		 332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1481  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.73 
 
 		 348 aa  152  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3537  transcriptional regulator, LacI family  31.43 
 
 		 354 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.234016 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2837  transcriptional regulator, LacI family  30.63 
 
 		 344 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672578  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1574  transcriptional regulator, LacI family  34.5 
 
 		 337 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6552  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  34.63 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  hitchhiker  0.0000198251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  35.33 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  30.27 
 
 		 339 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2074  transcriptional regulator, LacI family  28.8 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0710  transcriptional regulator, LacI family  33.64 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0832389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1104  periplasmic sugar binding transcriptional regulator  35.28 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  35.15 
 
 		 379 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1148  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.65 
 
 		 336 aa  149  8e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.907007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  33.84 
 
 		 354 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1128  transcriptional regulator, LacI family  31.33 
 
 		 361 aa  149  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  35 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 		 346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  31.44 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3984  transcriptional regulator, LacI family  32.91 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  33.01 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  34.55 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1014  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.78 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  34.08 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  33.96 
 
 		 346 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  32.69 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4247  alanine racemase  35.74 
 
 		 349 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.645123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5883  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.43 
 
 		 356 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.92391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>