More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7934 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7934  putative LacI-family transcriptional regulator  100 
 
 		 335 aa  652    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6090  transcriptional regulator, LacI family  59.88 
 
 		 347 aa  355  5e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4620  transcriptional regulator, LacI family  54.41 
 
 		 349 aa  334  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2567  transcriptional regulator, LacI family  54.12 
 
 		 342 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.789697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5940  transcriptional regulator, LacI family  51.84 
 
 		 347 aa  292  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146898  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3400  transcriptional regulator, LacI family  50.91 
 
 		 338 aa  291  9e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.125574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5754  transcriptional regulator, LacI family  51.37 
 
 		 348 aa  283  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.597528  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1691  transcriptional regulator, LacI family  50.45 
 
 		 341 aa  282  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0314799  normal  0.084893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2664  transcriptional regulator, LacI family  47.7 
 
 		 352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3259  alanine racemase  49.07 
 
 		 338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.884845  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3489  LacI family transcription regulator  48.77 
 
 		 338 aa  272  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148473  normal  0.0487492 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  46.57 
 
 		 349 aa  252  5.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1432  transcriptional regulator, LacI family  47.22 
 
 		 324 aa  252  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.629194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3975  transcriptional regulator, LacI family  43.12 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00653549  normal  0.0330479 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  45.57 
 
 		 346 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2268  transcriptional regulator, LacI family  43.55 
 
 		 338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5028  transcriptional regulator, LacI family  41.69 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.108824  normal  0.722196 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3964  transcriptional regulator, LacI family  43.08 
 
 		 332 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147565  normal  0.0529978 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  37.57 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3595  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.82 
 
 		 356 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.199823 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0995  transcriptional regulator, LacI family  43.41 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3961  transcriptional regulator, LacI family  41.69 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0946705 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  36.56 
 
 		 342 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  38.84 
 
 		 333 aa  195  9e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4767  transcriptional regulator, LacI family  38.89 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  38.23 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2013  transcriptional regulator, LacI family  39.52 
 
 		 341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  37.54 
 
 		 354 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  37.95 
 
 		 342 aa  189  5.999999999999999e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.97 
 
 		 352 aa  189  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  37.31 
 
 		 353 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.25 
 
 		 347 aa  185  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  36.5 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  36.75 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  36.92 
 
 		 343 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.84 
 
 		 338 aa  179  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  39.02 
 
 		 353 aa  179  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  36.17 
 
 		 334 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1971  LacI family transcription regulator  36.45 
 
 		 352 aa  177  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137395  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  35.56 
 
 		 330 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  35.37 
 
 		 348 aa  174  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  35.74 
 
 		 340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  34.13 
 
 		 347 aa  173  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  34.03 
 
 		 346 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  34.63 
 
 		 339 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  34.93 
 
 		 357 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  34.94 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  31.52 
 
 		 341 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2837  transcriptional regulator, LacI family  32.54 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.672578  normal  0.365252 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  33.73 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.4 
 
 		 356 aa  169  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  34.97 
 
 		 332 aa  169  7e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.28 
 
 		 335 aa  169  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  34.94 
 
 		 340 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0299  transcriptional regulator protein  35.53 
 
 		 365 aa  168  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.01 
 
 		 336 aa  169  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  34.87 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  37.28 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  34.97 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0710  transcriptional regulator, LacI family  36.17 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0832389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  30.91 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0870  alanine racemase  35.37 
 
 		 351 aa  166  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.82 
 
 		 339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1005  transcriptional regulator, LacI family  29.79 
 
 		 336 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  34.97 
 
 		 337 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  30.79 
 
 		 336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4368  transcriptional regulator, LacI family  36.29 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.0119453 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  32.53 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  38.67 
 
 		 333 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  35.38 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3049  transcriptional regulator, LacI family  28.31 
 
 		 336 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.490257  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 		 340 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2376  transcriptional regulator, LacI family  35.03 
 
 		 352 aa  162  8.000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38350  transcriptional regulator  35.87 
 
 		 343 aa  162  9e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.8 
 
 		 335 aa  162  9e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  33.74 
 
 		 358 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6552  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  36.2 
 
 		 376 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  hitchhiker  0.0000198251 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  32.42 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1374  transcriptional regulator, LacI family  33.92 
 
 		 357 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  37.85 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  35.56 
 
 		 353 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.8 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  31.23 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  36.94 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1481  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.24 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.11 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  32.11 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  32.11 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3109  transcriptional regulator, LacI family  35.83 
 
 		 337 aa  159  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  31.38 
 
 		 330 aa  159  8e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  37.3 
 
 		 354 aa  159  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3559  transcriptional regulator, LacI family  37.08 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.156963  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1478  transcriptional regulator, LacI family  34.13 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764656  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1984  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 360 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2074  transcriptional regulator, LacI family  30.65 
 
 		 338 aa  157  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0624  LacI family transcription regulator  34.42 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.393739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3308  LacI family transcription regulator  37.01 
 
 		 346 aa  157  4e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6927  LacI family transcription regulator  36.98 
 
 		 345 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>