More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1478 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1478  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 348 aa  691    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764656  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1374  transcriptional regulator, LacI family  93.95 
 
 		 357 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  72.78 
 
 		 347 aa  510  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  69.82 
 
 		 352 aa  476  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1971  LacI family transcription regulator  69.23 
 
 		 352 aa  473  1e-132  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0870  alanine racemase  70.12 
 
 		 351 aa  471  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2376  transcriptional regulator, LacI family  58.08 
 
 		 352 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  44.18 
 
 		 357 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  44.74 
 
 		 358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1775  transcriptional regulator, LacI family  44.35 
 
 		 350 aa  274  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.443552 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3336  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.64 
 
 		 341 aa  262  6e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0752084  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0565  LacI family transcription regulator  42.59 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2652  LacI family transcription regulator  40.91 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126307  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0272  LacI family transcription regulator  41.14 
 
 		 365 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.419733  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0624  LacI family transcription regulator  38.71 
 
 		 348 aa  239  6.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.393739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3383  LacI family transcription regulator  40.2 
 
 		 344 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0237122 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01228  transcriptional regulator  42.81 
 
 		 354 aa  236  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00348706  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3749  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.4 
 
 		 344 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1853  LacI family transcription regulator  39.82 
 
 		 340 aa  229  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0619869  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3568  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.79 
 
 		 339 aa  229  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0984  transcriptional regulator, putative  38.69 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.879842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4283  LacI family transcription regulator  37.05 
 
 		 341 aa  228  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0926  putative transcriptional regulator  38.1 
 
 		 339 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.133438  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1376  alanine racemase  37.8 
 
 		 339 aa  222  8e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2846  LacI family transcription regulator  37.31 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3381  transcriptional regulator, LacI family  37.42 
 
 		 340 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289071 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3679  transcriptional regulator, LacI family  37.42 
 
 		 340 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.196909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1177  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.05 
 
 		 360 aa  205  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3927  LacI family transcription regulator  38.6 
 
 		 334 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5078  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.23 
 
 		 337 aa  202  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0397942  normal  0.741474 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3792  transcriptional regulator LacI family  35.91 
 
 		 341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.190437  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2764  alanine racemase  35.74 
 
 		 340 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0923309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5940  transcriptional regulator, LacI family  38.62 
 
 		 347 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146898  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0074  LacI family transcription regulator  35.9 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.840414  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  34.97 
 
 		 346 aa  186  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1618  DNA-binding transcriptional repressor MalI  30.79 
 
 		 340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.671811  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1861  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.453605  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  32.14 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  34.72 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.04 
 
 		 333 aa  176  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  31.04 
 
 		 333 aa  176  7e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  33.03 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.23 
 
 		 336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  31.55 
 
 		 337 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  32.04 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2664  transcriptional regulator, LacI family  35.71 
 
 		 352 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.42 
 
 		 352 aa  169  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  32.24 
 
 		 336 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.61 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  34.87 
 
 		 342 aa  166  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  30.65 
 
 		 368 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  35.1 
 
 		 336 aa  165  9e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  34.5 
 
 		 338 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  29.25 
 
 		 342 aa  164  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  30.63 
 
 		 335 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  33.24 
 
 		 355 aa  163  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  34.32 
 
 		 339 aa  162  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38350  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1756  transcriptional regulator, LacI family  35.96 
 
 		 357 aa  162  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  32.74 
 
 		 352 aa  161  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  32.94 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  34.82 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 		 340 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  28.74 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  32.94 
 
 		 340 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  34.03 
 
 		 353 aa  159  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  34.12 
 
 		 339 aa  159  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  32.94 
 
 		 340 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.58 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7934  putative LacI-family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  37.35 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  32.93 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.53 
 
 		 335 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5343  transcriptional regulator, LacI family  35.26 
 
 		 346 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629268  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0309  transcriptional regulator, LacI family  35.74 
 
 		 346 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3608  transcriptional regulator, LacI family  38.05 
 
 		 339 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.024376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  30.06 
 
 		 347 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  32.63 
 
 		 332 aa  156  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  32.63 
 
 		 332 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 346 aa  157  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6927  LacI family transcription regulator  38.9 
 
 		 345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3131  transcriptional regulator, LacI family  29.22 
 
 		 334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  hitchhiker  0.005841 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  30.15 
 
 		 341 aa  156  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0262  LacI family transcription regulator  33.04 
 
 		 344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1769  LacI family transcription regulator  31.79 
 
 		 339 aa  156  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3654  LacI family transcription regulator  34.12 
 
 		 354 aa  155  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  30.68 
 
 		 336 aa  155  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3595  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.05 
 
 		 356 aa  155  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.199823 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  32.42 
 
 		 332 aa  155  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  32.63 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  32.63 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2646  transcriptional regulator, LacI family  35.78 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  32.34 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  32.34 
 
 		 332 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05790  transcriptional regulator  35.55 
 
 		 347 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1187  LacI family regulatory protein  34.11 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34285  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5109  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  34.62 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>