More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5343 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5343  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 346 aa  669    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629268  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1710  LacI family transcription regulator  66.96 
 
 		 344 aa  432  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2029  transcriptional regulator, LacI family  66.57 
 
 		 343 aa  418  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6728  transcriptional regulator, LacI family  59.41 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2456  LacI family transcription regulator  50.44 
 
 		 352 aa  317  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  50.3 
 
 		 339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06650  transcriptional regulator, LacI family  50.14 
 
 		 355 aa  285  5.999999999999999e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.742485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0922  regulatory protein LacI  55.62 
 
 		 358 aa  282  6.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000135771  normal  0.0875703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0141  transcriptional regulator, LacI family  48.8 
 
 		 352 aa  269  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3360  transcriptional regulator, LacI family  51.99 
 
 		 341 aa  266  5e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706922  normal  0.566269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1201  transcriptional regulator, LacI family  48.62 
 
 		 369 aa  266  5.999999999999999e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1039  transcriptional regulator, LacI family  48.37 
 
 		 335 aa  265  8e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2426  LacI family transcription regulator  45.73 
 
 		 365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0287642  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0888  transcriptional regulator, LacI family  49.12 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2180  transcriptional regulator, LacI family  46.09 
 
 		 362 aa  215  7e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000177462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5609  transcriptional regulator, LacI family  39.04 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.918493 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28980  transcriptional regulator  42.48 
 
 		 373 aa  210  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  38.39 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  40.99 
 
 		 374 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0580  LacI family response repressor  37.32 
 
 		 352 aa  196  6e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  32 
 
 		 342 aa  192  6e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.45 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  36.92 
 
 		 348 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.94 
 
 		 337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  36.72 
 
 		 353 aa  182  7e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0629  LacI family transcription regulator  29.22 
 
 		 339 aa  182  9.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.409769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  36.08 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2994  DNA-binding transcriptional regulator GalS  36.05 
 
 		 332 aa  179  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.04 
 
 		 335 aa  176  7e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  33.44 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  32.43 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  37.01 
 
 		 339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  36.76 
 
 		 346 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  34.82 
 
 		 334 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  34.55 
 
 		 337 aa  173  5e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  36.99 
 
 		 343 aa  172  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  34.6 
 
 		 340 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0686  LacI family transcription regulator  34.12 
 
 		 334 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  32.56 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  36.36 
 
 		 342 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  35.71 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002667  Galactose operon repressor  34.88 
 
 		 332 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  36.95 
 
 		 353 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  33.44 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2083  LacI family transcription regulator  32.46 
 
 		 342 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1062  DNA-binding transcriptional regulator GalS  34.48 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03325  transcriptional regulator  34.98 
 
 		 332 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3009  transcriptional regulator, LacI family  44.67 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0822147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  29.59 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.08 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  29.67 
 
 		 339 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 342 aa  169  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  32.08 
 
 		 341 aa  169  7e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.01 
 
 		 352 aa  169  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  29.17 
 
 		 342 aa  169  7e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  34.35 
 
 		 368 aa  169  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  35.21 
 
 		 338 aa  169  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  31.23 
 
 		 331 aa  169  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  29.75 
 
 		 355 aa  169  9e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  34.9 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  35.67 
 
 		 391 aa  168  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0761  DNA-binding transcriptional regulator GalR  37.42 
 
 		 348 aa  169  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.533461  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  35.01 
 
 		 336 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001746  transcriptional (co)regulator CytR  34.07 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1050  transcriptional regulator, LacI family  35.8 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.107431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  34.99 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3832  DNA-binding transcriptional regulator GalR  34.44 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  34.2 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03798  galactose operon repressor  33.44 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4116  alanine racemase  36.1 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  34.2 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0734  transcriptional regulator, LacI family  35.42 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  34.68 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  36 
 
 		 342 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  31.02 
 
 		 328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  35.5 
 
 		 338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3278  DNA-binding transcriptional regulator GalR  35.33 
 
 		 338 aa  165  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.87 
 
 		 337 aa  165  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02685  DNA-binding transcriptional repressor  34.77 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0853  transcriptional regulator, LacI family  35.1 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3157  DNA-binding transcriptional regulator GalR  34.77 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674454  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2985  DNA-binding transcriptional regulator GalR  35.1 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0409403 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02646  hypothetical protein  34.77 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0878  DNA-binding transcriptional regulator GalR  34.77 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3025  DNA-binding transcriptional regulator GalR  34.77 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1286  LacI family transcription regulator  30.9 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000013505  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4106  DNA-binding transcriptional regulator GalR  35.1 
 
 		 343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73393  hitchhiker  0.000026097 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2984  DNA-binding transcriptional regulator GalR  34.77 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1620  LacI family transcription regulator  37.82 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  32.76 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1916  LacI family transcription regulator  35.02 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  33.62 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  30.5 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  29.78 
 
 		 336 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  36.21 
 
 		 335 aa  164  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  33.05 
 
 		 346 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5756  transcriptional regulator, LacI family  35.86 
 
 		 347 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  33.91 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  33.91 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  33.72 
 
 		 340 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>