More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1039 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1039  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 
335 aa  662    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1710  LacI family transcription regulator  47.31 
 
 
344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5343  transcriptional regulator, LacI family  48.37 
 
 
346 aa  265  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2029  transcriptional regulator, LacI family  46.41 
 
 
343 aa  261  8.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259814  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0141  transcriptional regulator, LacI family  44.91 
 
 
352 aa  248  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2456  LacI family transcription regulator  42.77 
 
 
352 aa  242  6e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6728  transcriptional regulator, LacI family  47.15 
 
 
330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.51 
 
 
339 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0922  regulatory protein LacI  44.84 
 
 
358 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000135771  normal  0.0875703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3360  transcriptional regulator, LacI family  42.35 
 
 
341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706922  normal  0.566269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1201  transcriptional regulator, LacI family  42.9 
 
 
369 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0888  transcriptional regulator, LacI family  44.12 
 
 
349 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06650  transcriptional regulator, LacI family  40.46 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.742485  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2426  LacI family transcription regulator  38.4 
 
 
365 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0287642  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28980  transcriptional regulator  42.17 
 
 
373 aa  179  8e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5609  transcriptional regulator, LacI family  35.93 
 
 
335 aa  175  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.918493 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2180  transcriptional regulator, LacI family  39.75 
 
 
362 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000177462 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0629  LacI family transcription regulator  30.58 
 
 
339 aa  172  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.409769  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  38.79 
 
 
374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0580  LacI family response repressor  36.59 
 
 
352 aa  164  3e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  31.67 
 
 
335 aa  162  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0134  transcriptional regulator, LacI family  34.12 
 
 
360 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  34.95 
 
 
333 aa  160  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1608  HTH-type transcriptional regulator GalR  36.01 
 
 
340 aa  159  8e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.656083  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  34.69 
 
 
337 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  34.72 
 
 
337 aa  155  6e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  34.6 
 
 
353 aa  155  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  31.67 
 
 
342 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  34.68 
 
 
340 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.55 
 
 
336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3795  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.85 
 
 
356 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.37 
 
 
342 aa  152  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  28.99 
 
 
340 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4417  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 
351 aa  151  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.68385 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.05 
 
 
342 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5848  LacI family transcription regulator  34.01 
 
 
365 aa  150  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.05 
 
 
342 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2511  transcriptional regulator, LacI family  36.13 
 
 
334 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155489  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5756  transcriptional regulator, LacI family  35.1 
 
 
347 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  35.01 
 
 
353 aa  149  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002667  Galactose operon repressor  32.46 
 
 
332 aa  149  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3013  transcriptional regulator, LacI family  38.62 
 
 
326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168933  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.56 
 
 
337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  34.33 
 
 
349 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  28.53 
 
 
334 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2467  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 
336 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1486  transcriptional regulator, LacI family  34.41 
 
 
334 aa  146  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.479144 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1396  LacI family transcription regulator  30.97 
 
 
332 aa  145  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.188133  hitchhiker  0.000600717 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  30.65 
 
 
347 aa  145  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  32.34 
 
 
348 aa  145  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1728  LacI family transcription regulator  36.98 
 
 
348 aa  145  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531296  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  29.08 
 
 
333 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2954  DNA-binding transcriptional regulator GalR  32.34 
 
 
336 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3001  transcriptional regulator, LacI family  35.07 
 
 
343 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.24 
 
 
330 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0182  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.85 
 
 
347 aa  143  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0116  DNA-binding transcriptional regulator CytR  33.22 
 
 
356 aa  143  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0168  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.14 
 
 
347 aa  143  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.66 
 
 
341 aa  143  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1965  LacI family transcription regulator  32.05 
 
 
338 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1855  LacI family sugar-binding transcriptional regulator  32.05 
 
 
338 aa  142  6e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0880  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 
338 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  31.1 
 
 
386 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3340  LacI family transcription regulator  32.46 
 
 
340 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  29.25 
 
 
340 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02080  DNA-binding transcriptional repressor  32.65 
 
 
346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.451006  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  32.05 
 
 
343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1497  DNA-binding transcriptional regulator GalS  32.65 
 
 
346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02039  hypothetical protein  32.65 
 
 
346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1324  DNA-binding transcriptional regulator GalR  32.05 
 
 
336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  26.87 
 
 
339 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  32.05 
 
 
343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  32.05 
 
 
343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3513  LacI family transcription regulator  34.02 
 
 
338 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.98216  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2298  DNA-binding transcriptional regulator GalS  32.65 
 
 
346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335365 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1025  DNA-binding transcriptional regulator GalR  31.85 
 
 
340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  29.25 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3249  DNA-binding transcriptional regulator GalR  31.85 
 
 
340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000735815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 
354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0972  DNA-binding transcriptional regulator GalR  31.85 
 
 
340 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  32.15 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3285  DNA-binding transcriptional regulator GalS  32.65 
 
 
346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2285  DNA-binding transcriptional regulator GalS  32.65 
 
 
346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1507  transcriptional regulator, LacI family  32.65 
 
 
346 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3620  transcriptional regulator, LacI family  33.75 
 
 
337 aa  140  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  32.75 
 
 
340 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3832  DNA-binding transcriptional regulator GalR  32.44 
 
 
339 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  29.79 
 
 
334 aa  140  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  32.46 
 
 
346 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  34.42 
 
 
331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2751  DNA-binding transcriptional regulator GalS  32.34 
 
 
340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.32 
 
 
337 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03325  transcriptional regulator  32.34 
 
 
332 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2382  DNA-binding transcriptional regulator GalS  33.04 
 
 
340 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.824252 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1562  DNA-binding transcriptional regulator GalS  32.36 
 
 
345 aa  139  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6831  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 
337 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.75 
 
 
341 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.75 
 
 
341 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.75 
 
 
341 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.75 
 
 
341 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>