More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1685 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 
337 aa  683    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  45.07 
 
 
340 aa  280  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  45.24 
 
 
344 aa  259  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  45.35 
 
 
473 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  40.83 
 
 
340 aa  238  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  42.94 
 
 
338 aa  235  8e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0459  LacI family transcription regulator  37.5 
 
 
340 aa  232  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  41.67 
 
 
331 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  41.84 
 
 
339 aa  230  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.69 
 
 
335 aa  229  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  42.51 
 
 
335 aa  227  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  41.69 
 
 
350 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.07 
 
 
337 aa  226  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  40.95 
 
 
344 aa  225  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  35.91 
 
 
338 aa  225  8e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  35.5 
 
 
337 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  41.32 
 
 
339 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  40.29 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  41.43 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  41.14 
 
 
335 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  39.1 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  38.99 
 
 
346 aa  219  7e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  40 
 
 
340 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  40.12 
 
 
343 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03890  transcriptional regulator, LacI family  40.18 
 
 
337 aa  217  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  37.39 
 
 
353 aa  216  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3965  Alanine racemase  41.62 
 
 
338 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.578436 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 
333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4021  transcriptional regulator, LacI family  38.81 
 
 
350 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613602  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2841  transcriptional regulator, LacI family  40.9 
 
 
345 aa  212  5.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  36.39 
 
 
337 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  37.91 
 
 
337 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  37.13 
 
 
336 aa  211  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  38.62 
 
 
361 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  36.31 
 
 
329 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.41 
 
 
348 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  38.94 
 
 
348 aa  209  4e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3030  transcriptional regulator, LacI family  42.04 
 
 
342 aa  208  8e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1878  transcriptional regulator, LacI family  39.08 
 
 
351 aa  208  9e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0941149  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  36.76 
 
 
336 aa  208  9e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  37.83 
 
 
346 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  34.22 
 
 
341 aa  207  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  37.72 
 
 
347 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5334  transcriptional regulator, LacI family  40.9 
 
 
339 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.431046 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0307  transcriptional regulator, LacI family  38.81 
 
 
337 aa  208  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.211089  normal  0.109292 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  34.69 
 
 
339 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  37.83 
 
 
346 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3075  transcriptional regulator, LacI family  40.9 
 
 
338 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 
335 aa  206  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  36.83 
 
 
368 aa  206  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  35.22 
 
 
348 aa  205  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  35.52 
 
 
339 aa  204  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  37.2 
 
 
386 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  38.26 
 
 
351 aa  203  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  39.4 
 
 
338 aa  202  6e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.03 
 
 
352 aa  202  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0210  LacI family transcription regulator  33.24 
 
 
353 aa  202  8e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000188149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  34.02 
 
 
341 aa  202  9e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  33.04 
 
 
342 aa  202  9e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.14 
 
 
336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  38.86 
 
 
357 aa  200  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  36.47 
 
 
347 aa  200  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.02 
 
 
330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5673  transcriptional regulator, LacI family  39.94 
 
 
343 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227027  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08380  transcriptional regulator  38.44 
 
 
351 aa  199  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.689367  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  37.83 
 
 
339 aa  199  7.999999999999999e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  35.99 
 
 
347 aa  198  9e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  39.53 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  37.31 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7169  transcriptional repressor RbsR  37.57 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0351473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3491  transcriptional regulator, LacI family  38.89 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.201292  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  34.01 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03609  transcriptional regulator LacI family  42.19 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.34339  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.14 
 
 
336 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  37.09 
 
 
333 aa  196  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  36.09 
 
 
334 aa  195  8.000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 
343 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 
343 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 
343 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 
343 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 
343 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 
343 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0403  transcriptional regulator, LacI family  38.17 
 
 
350 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  35.71 
 
 
343 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  32.75 
 
 
343 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  32.75 
 
 
343 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  32.75 
 
 
343 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  32.75 
 
 
343 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  32.75 
 
 
343 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  32.75 
 
 
340 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  32.75 
 
 
343 aa  193  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  41.19 
 
 
359 aa  193  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  32.17 
 
 
340 aa  192  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  33.83 
 
 
331 aa  192  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  33.72 
 
 
341 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  34.91 
 
 
342 aa  192  6e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  37.17 
 
 
349 aa  192  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  34.21 
 
 
340 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  31.88 
 
 
343 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  35.31 
 
 
334 aa  191  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>