More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28980 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_28980  transcriptional regulator  100 
 
 		 373 aa  726    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0888  transcriptional regulator, LacI family  43.84 
 
 		 349 aa  223  4e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1710  LacI family transcription regulator  40.33 
 
 		 344 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2029  transcriptional regulator, LacI family  40.6 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5343  transcriptional regulator, LacI family  42.48 
 
 		 346 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629268  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2456  LacI family transcription regulator  40.75 
 
 		 352 aa  215  8e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  40.68 
 
 		 339 aa  199  9e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6728  transcriptional regulator, LacI family  44.16 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1039  transcriptional regulator, LacI family  42.17 
 
 		 335 aa  188  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2426  LacI family transcription regulator  40.23 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0287642  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0922  regulatory protein LacI  43.97 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000135771  normal  0.0875703 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2180  transcriptional regulator, LacI family  39.57 
 
 		 362 aa  176  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000177462 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1201  transcriptional regulator, LacI family  39.37 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3360  transcriptional regulator, LacI family  40.85 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706922  normal  0.566269 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06650  transcriptional regulator, LacI family  39.82 
 
 		 355 aa  172  9e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.742485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  36.17 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0141  transcriptional regulator, LacI family  36.19 
 
 		 352 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5609  transcriptional regulator, LacI family  36.51 
 
 		 335 aa  155  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.918493 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.75 
 
 		 337 aa  152  8e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  32.81 
 
 		 333 aa  149  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  32.28 
 
 		 368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  31.06 
 
 		 342 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0629  LacI family transcription regulator  28.75 
 
 		 339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.409769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  33.65 
 
 		 333 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3091  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.224445  normal  0.366148 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  32.19 
 
 		 343 aa  138  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.55 
 
 		 337 aa  137  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0919  LacI family transcription regulator  27.36 
 
 		 327 aa  136  7.000000000000001e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20530  transcriptional regulator, LacI family  28.66 
 
 		 341 aa  135  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0580  LacI family response repressor  34.05 
 
 		 352 aa  135  9e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.65 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  33.96 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.19 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  32.19 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.19 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  32.19 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  35.42 
 
 		 374 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.19 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.19 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.19 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.19 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.18 
 
 		 330 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.86 
 
 		 341 aa  133  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02080  DNA-binding transcriptional repressor  32.8 
 
 		 346 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.451006  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02039  hypothetical protein  32.8 
 
 		 346 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2298  DNA-binding transcriptional regulator GalS  32.81 
 
 		 346 aa  132  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335365 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1497  DNA-binding transcriptional regulator GalS  32.81 
 
 		 346 aa  132  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  29.58 
 
 		 332 aa  132  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2285  DNA-binding transcriptional regulator GalS  32.81 
 
 		 346 aa  132  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3285  DNA-binding transcriptional regulator GalS  32.6 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1062  DNA-binding transcriptional regulator GalS  31.53 
 
 		 346 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30 
 
 		 331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002667  Galactose operon repressor  32.79 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1507  transcriptional regulator, LacI family  32.81 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  29.58 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0134  transcriptional regulator, LacI family  33.44 
 
 		 360 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  29.26 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2751  DNA-binding transcriptional regulator GalS  33.12 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  29.58 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  29.58 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  29.29 
 
 		 336 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2446  DNA-binding transcriptional regulator GalS  32.49 
 
 		 346 aa  129  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  29.58 
 
 		 332 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  29.58 
 
 		 332 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  28.94 
 
 		 332 aa  129  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  29.26 
 
 		 332 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  28.48 
 
 		 355 aa  129  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  29.58 
 
 		 332 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  32.28 
 
 		 337 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.72 
 
 		 335 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.89 
 
 		 341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.89 
 
 		 341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.89 
 
 		 341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  34.04 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.89 
 
 		 341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.89 
 
 		 341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0182  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.6 
 
 		 347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  28.14 
 
 		 347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0168  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.6 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2994  DNA-binding transcriptional regulator GalS  32.7 
 
 		 332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1396  LacI family transcription regulator  30.86 
 
 		 332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.188133  hitchhiker  0.000600717 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  32.6 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6160  transcriptional regulator, LacI family  31.96 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00050807 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0007  transcriptional regulator, LacI family  31.13 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1608  HTH-type transcriptional regulator GalR  30.53 
 
 		 340 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.656083  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3114  LacI family transcription regulator  32.7 
 
 		 350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0116195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  29.26 
 
 		 332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  27.73 
 
 		 335 aa  127  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0754  transcriptional regulator, LacI family  33.02 
 
 		 337 aa  126  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.143705  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  31.25 
 
 		 337 aa  126  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  31.63 
 
 		 337 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05320  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  30.84 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  28.12 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  34.47 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  31.35 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  29.25 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>