More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A3220 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  100 
 
 		 336 aa  688    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  38.55 
 
 		 342 aa  226  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  36.04 
 
 		 342 aa  225  9e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  36.7 
 
 		 348 aa  219  7e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  35.31 
 
 		 340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  35.14 
 
 		 353 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.28 
 
 		 336 aa  209  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  35.06 
 
 		 335 aa  206  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  34.95 
 
 		 343 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.17 
 
 		 352 aa  205  8e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  36.01 
 
 		 346 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  35.69 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  34.7 
 
 		 347 aa  203  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1922  LacI family transcription regulator  34.15 
 
 		 339 aa  203  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.704174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  34.64 
 
 		 338 aa  203  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20530  transcriptional regulator, LacI family  36.73 
 
 		 341 aa  202  8e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  33.64 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  33.54 
 
 		 340 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  36 
 
 		 332 aa  199  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  34.15 
 
 		 337 aa  198  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  33.54 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.77 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  35.71 
 
 		 332 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  35.71 
 
 		 332 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  34.08 
 
 		 334 aa  196  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  35.71 
 
 		 332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  35.71 
 
 		 332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  34.69 
 
 		 334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  33.93 
 
 		 332 aa  196  6e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  33.54 
 
 		 340 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  35.48 
 
 		 346 aa  195  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  35.4 
 
 		 332 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  35.71 
 
 		 332 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000152618  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  35.4 
 
 		 332 aa  195  9e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  35.4 
 
 		 332 aa  195  9e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  35.24 
 
 		 333 aa  194  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  33.84 
 
 		 340 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  34.03 
 
 		 349 aa  194  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  35.4 
 
 		 332 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  35.4 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  32.52 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3343  ribose operon repressor RbsR  33.54 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.142594  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  35.78 
 
 		 348 aa  193  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  31.94 
 
 		 368 aa  192  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  34.04 
 
 		 347 aa  192  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  32.73 
 
 		 337 aa  192  9e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1862  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.44 
 
 		 341 aa  192  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.171232  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1755  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.44 
 
 		 341 aa  192  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00265778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2572  DNA-binding transcriptional repressor PurR  35.44 
 
 		 341 aa  192  9e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.407544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  31.94 
 
 		 334 aa  192  9e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  34.65 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  34.65 
 
 		 343 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  32.01 
 
 		 338 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  33.03 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  34.65 
 
 		 343 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  32.84 
 
 		 333 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 333 aa  190  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2672  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.63 
 
 		 341 aa  189  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2195  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.9 
 
 		 341 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.578042  hitchhiker  0.00000679153 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.87 
 
 		 339 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.23 
 
 		 341 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.71 
 
 		 337 aa  189  7e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  32.48 
 
 		 341 aa  189  7e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  33.74 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  33.74 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  33.74 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  33.74 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  34.04 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2863  putative catabolite control protein A  35.35 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.953072  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2548  catabolite control protein A, putative  35.35 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3131  transcriptional regulator, LacI family  34.48 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  hitchhiker  0.005841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3620  transcriptional regulator, LacI family  34.37 
 
 		 342 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  34.04 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  34.04 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  34.04 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.23 
 
 		 341 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 357 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  33.53 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  33.83 
 
 		 333 aa  186  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4121  transcriptional regulator, LacI family  31.55 
 
 		 343 aa  186  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.944766 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  32.13 
 
 		 341 aa  186  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  32.36 
 
 		 338 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  31.89 
 
 		 336 aa  186  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  32.94 
 
 		 341 aa  185  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  32.94 
 
 		 341 aa  185  8e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.94 
 
 		 341 aa  185  8e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.94 
 
 		 341 aa  185  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.94 
 
 		 341 aa  185  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.94 
 
 		 341 aa  185  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.94 
 
 		 341 aa  185  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  32.94 
 
 		 341 aa  185  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.41 
 
 		 330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  31.85 
 
 		 333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  32.54 
 
 		 331 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  32.44 
 
 		 328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1744  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.34 
 
 		 341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000285436  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  33.13 
 
 		 331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1789  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.84 
 
 		 341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0286691 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1540  DNA-binding transcriptional repressor PurR  32.34 
 
 		 341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000065632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>