More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0141 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0141  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 352 aa  689    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1710  LacI family transcription regulator  48.22 
 
 		 344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2456  LacI family transcription regulator  49.7 
 
 		 352 aa  276  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5343  transcriptional regulator, LacI family  48.8 
 
 		 346 aa  269  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.629268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2029  transcriptional regulator, LacI family  45.7 
 
 		 343 aa  265  8.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2856  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  50 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6728  transcriptional regulator, LacI family  49.25 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1039  transcriptional regulator, LacI family  44.91 
 
 		 335 aa  248  9e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3360  transcriptional regulator, LacI family  45.13 
 
 		 341 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706922  normal  0.566269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0922  regulatory protein LacI  42.98 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000135771  normal  0.0875703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1201  transcriptional regulator, LacI family  42.15 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0888  transcriptional regulator, LacI family  45 
 
 		 349 aa  193  4e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06650  transcriptional regulator, LacI family  41.03 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.742485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6720  transcriptional regulator, LacI family  39.83 
 
 		 374 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2426  LacI family transcription regulator  39.88 
 
 		 365 aa  176  4e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0287642  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0629  LacI family transcription regulator  30.89 
 
 		 339 aa  170  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.409769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  31.79 
 
 		 342 aa  169  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.86 
 
 		 336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  36.55 
 
 		 349 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  34.91 
 
 		 332 aa  162  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.27 
 
 		 336 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  36.47 
 
 		 350 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  34.01 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28980  transcriptional regulator  36.19 
 
 		 373 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2180  transcriptional regulator, LacI family  38.58 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000177462 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  30.68 
 
 		 336 aa  153  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  36.36 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  35.14 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  30.47 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  30.81 
 
 		 335 aa  150  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  35.56 
 
 		 346 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  35.56 
 
 		 346 aa  150  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0580  LacI family response repressor  33.24 
 
 		 352 aa  149  5e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  30.5 
 
 		 338 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  35.41 
 
 		 339 aa  149  8e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  34.59 
 
 		 353 aa  149  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  35.33 
 
 		 347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  32.92 
 
 		 337 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  33.72 
 
 		 337 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  35.65 
 
 		 348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5756  transcriptional regulator, LacI family  35.71 
 
 		 347 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2503  transcriptional regulator  26.84 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117668  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0279  transcriptional regulator, LacI family  34.66 
 
 		 351 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  38.19 
 
 		 357 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  27.14 
 
 		 339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  34.08 
 
 		 333 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  35.93 
 
 		 344 aa  145  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5609  transcriptional regulator, LacI family  32.53 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.918493 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  29.11 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  30.28 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  29.53 
 
 		 336 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  32.67 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  28.99 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  34.81 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2751  DNA-binding transcriptional regulator GalS  36.48 
 
 		 340 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.84 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0134  transcriptional regulator, LacI family  33.8 
 
 		 360 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  34.25 
 
 		 354 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1062  DNA-binding transcriptional regulator GalS  33.55 
 
 		 346 aa  143  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3009  transcriptional regulator, LacI family  43.41 
 
 		 347 aa  143  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0822147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  33.14 
 
 		 342 aa  143  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.99 
 
 		 330 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.33 
 
 		 335 aa  142  7e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0343  LacI family transcription regulator  31.29 
 
 		 338 aa  142  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0241073  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6831  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 		 337 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  30.59 
 
 		 352 aa  142  9e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.26 
 
 		 337 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  33.33 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  26.87 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1507  transcriptional regulator, LacI family  36.66 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  29.97 
 
 		 329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2681  LacI family transcription regulator  31.45 
 
 		 335 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  32.34 
 
 		 368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2320  LacI family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316441  normal  0.202359 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  34.38 
 
 		 353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  30.26 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3766  LacI family transcription regulator  34.17 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3285  DNA-binding transcriptional regulator GalS  36.33 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.23 
 
 		 341 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02080  DNA-binding transcriptional repressor  36.33 
 
 		 346 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.451006  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1497  DNA-binding transcriptional regulator GalS  36.33 
 
 		 346 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2298  DNA-binding transcriptional regulator GalS  36.33 
 
 		 346 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0918  transcriptional regulator, LacI family  36.86 
 
 		 349 aa  140  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 331 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.81 
 
 		 348 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02039  hypothetical protein  36.33 
 
 		 346 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.361585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2285  DNA-binding transcriptional regulator GalS  36.33 
 
 		 346 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  31.23 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  31.23 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.23 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  31.23 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4691  transcriptional regulator, LacI family  34.27 
 
 		 340 aa  139  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0374666  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.23 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.86 
 
 		 356 aa  139  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.23 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.23 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  31.23 
 
 		 341 aa  139  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 339 aa  139  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  32.17 
 
 		 336 aa  139  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>