More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1895 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  100 
 
 		 339 aa  672    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  77.58 
 
 		 335 aa  522  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  68.62 
 
 		 340 aa  454  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  64.5 
 
 		 348 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  62.87 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  63.31 
 
 		 348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  61.45 
 
 		 338 aa  394  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  56.5 
 
 		 335 aa  358  9e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  57.1 
 
 		 335 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  57.99 
 
 		 339 aa  352  4e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  56.42 
 
 		 344 aa  348  6e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  56.8 
 
 		 331 aa  348  8e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  54.76 
 
 		 343 aa  335  5e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  54.93 
 
 		 473 aa  330  3e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  53.92 
 
 		 343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7169  transcriptional repressor RbsR  52.57 
 
 		 331 aa  319  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5334  transcriptional regulator, LacI family  58.36 
 
 		 339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.431046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  54.65 
 
 		 344 aa  312  5.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  50.15 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  48.37 
 
 		 346 aa  288  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2841  transcriptional regulator, LacI family  50 
 
 		 345 aa  287  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4021  transcriptional regulator, LacI family  49.4 
 
 		 350 aa  275  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613602  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  46.63 
 
 		 350 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5673  transcriptional regulator, LacI family  49.1 
 
 		 343 aa  271  9e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3491  transcriptional regulator, LacI family  48.69 
 
 		 349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.201292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6684  transcriptional regulator, LacI family  50 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.594008 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  45.86 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03890  transcriptional regulator, LacI family  45.92 
 
 		 337 aa  266  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3075  transcriptional regulator, LacI family  49.7 
 
 		 338 aa  262  8e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3965  Alanine racemase  47.45 
 
 		 338 aa  260  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.578436 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3030  transcriptional regulator, LacI family  45.97 
 
 		 342 aa  252  8.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  47.65 
 
 		 357 aa  250  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08380  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 351 aa  249  5e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.689367  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1878  transcriptional regulator, LacI family  46.73 
 
 		 351 aa  247  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0941149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0307  transcriptional regulator, LacI family  42.12 
 
 		 337 aa  246  4e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.211089  normal  0.109292 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  45.97 
 
 		 359 aa  246  4e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2615  transcriptional regulator, LacI family  44.91 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0403  transcriptional regulator, LacI family  45.78 
 
 		 350 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  41.84 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  38.07 
 
 		 340 aa  222  7e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  35.54 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.84 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04030  transcriptional regulator  40.52 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  37.94 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  38.67 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0376  transcriptional regulator, LacI family  37.64 
 
 		 358 aa  199  6e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  35.1 
 
 		 341 aa  199  7.999999999999999e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  38.44 
 
 		 382 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1193  transcriptional regulator, LacI family  39.7 
 
 		 335 aa  196  6e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  36.56 
 
 		 339 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  36.83 
 
 		 353 aa  195  9e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  34.94 
 
 		 337 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  37.09 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  36.98 
 
 		 331 aa  193  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  36.12 
 
 		 335 aa  192  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.2 
 
 		 337 aa  192  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  34.44 
 
 		 338 aa  192  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  34.82 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  34.51 
 
 		 386 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  39.04 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  34.14 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  34.14 
 
 		 341 aa  186  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  36.56 
 
 		 333 aa  187  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  37.13 
 
 		 353 aa  187  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.12 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0944  transcriptional regulator, LacI family  41.09 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  34.23 
 
 		 342 aa  185  8e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  35.33 
 
 		 348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  35.74 
 
 		 337 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1333  transcriptional regulator, LacI family  36.98 
 
 		 347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00834702  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0566  transcriptional regulator, LacI family  35.8 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  37.39 
 
 		 326 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0007  transcriptional regulator, LacI family  35.74 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  34.98 
 
 		 340 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  35.65 
 
 		 339 aa  183  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0420  LacI family transcription regulator  33.83 
 
 		 330 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.84 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  37.01 
 
 		 337 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  37.13 
 
 		 335 aa  182  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  34.93 
 
 		 341 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  34.98 
 
 		 343 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  35.55 
 
 		 341 aa  182  8.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  35.09 
 
 		 342 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  34.94 
 
 		 342 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  35.15 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.23 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.23 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  33.44 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.23 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.23 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.23 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  34.37 
 
 		 343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  34.37 
 
 		 343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  34.37 
 
 		 343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  37.46 
 
 		 338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  34.37 
 
 		 343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  34.37 
 
 		 343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  34.37 
 
 		 340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  36.12 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>