More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1561 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  100 
 
 		 348 aa  687    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  88.22 
 
 		 348 aa  599  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  64.39 
 
 		 335 aa  421  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  63.31 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  60.81 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  58.16 
 
 		 340 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  57.57 
 
 		 338 aa  358  6e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  55.92 
 
 		 335 aa  338  7e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  57.18 
 
 		 335 aa  333  2e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  55.19 
 
 		 343 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  56.25 
 
 		 344 aa  328  9e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  54.01 
 
 		 344 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  56.89 
 
 		 339 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  53.64 
 
 		 473 aa  323  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 331 aa  318  7e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  52.1 
 
 		 343 aa  317  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7169  transcriptional repressor RbsR  53.1 
 
 		 331 aa  302  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5334  transcriptional regulator, LacI family  54.3 
 
 		 339 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.431046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  49.42 
 
 		 361 aa  288  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  47.92 
 
 		 346 aa  280  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2841  transcriptional regulator, LacI family  50 
 
 		 345 aa  277  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4021  transcriptional regulator, LacI family  50.32 
 
 		 350 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613602  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3965  Alanine racemase  49.55 
 
 		 338 aa  267  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.578436 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1878  transcriptional regulator, LacI family  46.88 
 
 		 351 aa  265  8.999999999999999e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0941149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  45.4 
 
 		 350 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03890  transcriptional regulator, LacI family  45.43 
 
 		 337 aa  255  9e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  47.28 
 
 		 357 aa  248  9e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08380  transcriptional regulator  47.76 
 
 		 351 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.689367  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3491  transcriptional regulator, LacI family  46.38 
 
 		 349 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.201292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3030  transcriptional regulator, LacI family  44.94 
 
 		 342 aa  243  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6684  transcriptional regulator, LacI family  49.85 
 
 		 338 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.594008 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  43.2 
 
 		 338 aa  242  6e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5673  transcriptional regulator, LacI family  46.47 
 
 		 343 aa  242  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227027  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  45.1 
 
 		 359 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3075  transcriptional regulator, LacI family  49.06 
 
 		 338 aa  239  5e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0307  transcriptional regulator, LacI family  40.95 
 
 		 337 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.211089  normal  0.109292 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2615  transcriptional regulator, LacI family  48.5 
 
 		 337 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0403  transcriptional regulator, LacI family  42.01 
 
 		 350 aa  219  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  39.59 
 
 		 339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  38.28 
 
 		 340 aa  216  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  34.67 
 
 		 341 aa  211  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  39.41 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  40.12 
 
 		 353 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  35.01 
 
 		 337 aa  205  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  37.28 
 
 		 336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  34.22 
 
 		 333 aa  199  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.81 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  37.57 
 
 		 334 aa  196  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0944  transcriptional regulator, LacI family  42.14 
 
 		 334 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  38.46 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  33.83 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  35.1 
 
 		 335 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  34.42 
 
 		 339 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4797  LacI family transcription regulator  38.89 
 
 		 336 aa  188  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.184791  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04030  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  36.58 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  38.58 
 
 		 339 aa  186  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  37.1 
 
 		 348 aa  186  7e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  37.18 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14260  transcriptional regulator  38.12 
 
 		 330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419378  normal  0.681325 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0376  transcriptional regulator, LacI family  35.43 
 
 		 358 aa  182  6e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1193  transcriptional regulator, LacI family  38.87 
 
 		 335 aa  182  9.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  34.82 
 
 		 328 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  32.56 
 
 		 342 aa  179  4.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  34.12 
 
 		 331 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0861  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.47 
 
 		 292 aa  179  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.19022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  34.72 
 
 		 329 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2858  LacI family transcription regulator  36.76 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.640321  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.78 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  35.76 
 
 		 332 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.22 
 
 		 330 aa  178  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.86 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  36.63 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2594  transcriptional regulator, LacI family  37.98 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  34.3 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4061  maltose operon transcriptional repressor  31.86 
 
 		 343 aa  176  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.86 
 
 		 335 aa  176  7e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  35.8 
 
 		 333 aa  175  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  31.27 
 
 		 342 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.9 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3919  maltose operon transcriptional repressor  31.56 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3751  maltose operon transcriptional repressor  31.56 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4226  maltose operon transcriptional repressor  31.56 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  34.31 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  33.55 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4028  maltose operon transcriptional repressor  31.56 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0210  LacI family transcription regulator  27.54 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000188149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4116  maltose operon transcriptional repressor  31.86 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271073  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4134  maltose operon transcriptional repressor  31.56 
 
 		 340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3767  maltose operon transcriptional repressor  31.56 
 
 		 343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.44 
 
 		 333 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  35.03 
 
 		 342 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  32.44 
 
 		 333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3838  LacI family transcription regulator  31.56 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  31.2 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1123  maltose operon transcriptional repressor  31.86 
 
 		 343 aa  173  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 332 aa  173  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  35.8 
 
 		 332 aa  173  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  35.69 
 
 		 352 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  31.67 
 
 		 336 aa  172  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>