More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1600 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  100 
 
 		 328 aa  662    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  98.17 
 
 		 328 aa  653    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  44.71 
 
 		 330 aa  294  1e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1559  alanine racemase  45.99 
 
 		 333 aa  288  6e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000066632  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1601  alanine racemase  45.4 
 
 		 337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.520299  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0285  alanine racemase  44.64 
 
 		 337 aa  280  2e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  37.8 
 
 		 332 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  36.67 
 
 		 353 aa  203  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  35.44 
 
 		 336 aa  199  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  36.06 
 
 		 333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  35.54 
 
 		 332 aa  195  7e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  37.83 
 
 		 346 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  37.83 
 
 		 346 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  36.01 
 
 		 337 aa  194  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  37.28 
 
 		 347 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  35.15 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  35.44 
 
 		 330 aa  189  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  34.13 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  36.86 
 
 		 337 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  36.2 
 
 		 339 aa  186  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  37.35 
 
 		 343 aa  185  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  36.04 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  35.37 
 
 		 329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  37.54 
 
 		 343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  37.54 
 
 		 343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.93 
 
 		 336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  34.73 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  33.74 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.76 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1526  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.64 
 
 		 341 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1913  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.64 
 
 		 341 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000592501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1563  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.64 
 
 		 341 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00208837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.86 
 
 		 330 aa  182  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  36.12 
 
 		 342 aa  182  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  33.53 
 
 		 331 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  36.75 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4642  ribose operon repressor  33.84 
 
 		 323 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.317022  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  36.75 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1744  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.34 
 
 		 341 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000285436  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  36.75 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1540  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.34 
 
 		 341 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000065632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  36.75 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.06 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  31.82 
 
 		 347 aa  179  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  34.71 
 
 		 339 aa  179  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0578  LacI family transcription regulator  33.54 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0721  ribose operon repressor  33.84 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.40772e-23 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  33.33 
 
 		 333 aa  179  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  35.82 
 
 		 357 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06936  hypothetical protein  36.78 
 
 		 340 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0793  ribose operon repressor  33.84 
 
 		 323 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00165994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0574  ribose operon repressor  33.84 
 
 		 323 aa  179  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  33.33 
 
 		 333 aa  179  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  36.06 
 
 		 340 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0366  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 344 aa  178  9e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0631  ribose operon repressor  33.54 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0664  ribose operon repressor  33.54 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.566043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0696  ribose operon repressor  33.54 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0732  ribose operon repressor  33.23 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1715  DNA-binding transcriptional repressor PurR  34.34 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0575  ribose operon repressor  33.54 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  33.23 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  34.65 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6160  transcriptional regulator, LacI family  35.15 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00050807 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  36.45 
 
 		 343 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  35.76 
 
 		 340 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  36.45 
 
 		 343 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 349 aa  176  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  36.45 
 
 		 343 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  36.45 
 
 		 343 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  32.14 
 
 		 339 aa  176  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1873  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.73 
 
 		 341 aa  176  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000326079  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.64 
 
 		 339 aa  176  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  35.76 
 
 		 340 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  32.72 
 
 		 346 aa  175  9e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01629  DNA-binding transcriptional repressor, hypoxanthine-binding  33.43 
 
 		 341 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.847977  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1982  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 341 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0168569  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1857  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.43 
 
 		 341 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000046163  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01618  hypothetical protein  33.43 
 
 		 341 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.850711  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1971  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.43 
 
 		 341 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1538  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.43 
 
 		 341 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0686294  normal  0.0781462 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2372  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.43 
 
 		 341 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000002203  normal  0.181026 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1738  DNA-binding transcriptional repressor PurR  33.43 
 
 		 341 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.20958e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  34.13 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  34.83 
 
 		 343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  35.24 
 
 		 348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0686  LacI family transcription regulator  33.72 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  33.23 
 
 		 337 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  35.65 
 
 		 340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  33.63 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  33.04 
 
 		 341 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.42 
 
 		 337 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.93 
 
 		 333 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  33.93 
 
 		 333 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3266  transcriptional regulator, LacI family  30.63 
 
 		 340 aa  172  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.030441 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0283  LacI family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 342 aa  172  9e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.881799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>